1.木耳泡水後，上面會殘留大量水分，這些水分與空氣中的細菌相互作用，會導致木耳腐爛變質。所以要完全控制水分才能長時間保持。木耳用漏勺控水後，放入有小孔通風的鍋中備用。
2.如果泡好的木耳能在壹天內吃完，完全控制水分後可以直接存放在冰箱上層，保持溫度在五度左右。這樣既不會讓木耳馬上腐爛，又能保持木耳的口感。
3.泡好的木耳壹天吃不完，大概要三天才能吃完。除了控制水分放入冰箱，還應該用保鮮膜或盒子保存泡好的木耳。保鮮膜或塑料盒可以將浸泡後的木耳與空氣隔離，防止木耳腐爛變質，可以保存更長時間。
4.如果泡過的木耳太多，三天吃不完，那就要把這些泡過的木耳放在太陽下繼續曬幹。氣溫高，陽光好的時候，直接把泡好的木耳放在陽光下暴曬，壹天就能完全曬幹，然後用袋子包好，放在幹燥的地方長期保存。
5.黑木耳泡太久會導致黑木耳滋生壹些細菌和黴菌，容易產生壹些毒素。所以泡好的黑木耳不能長時間保存。如果保存，必須風幹。