這些罕見的水晶頭骨要麽被私人收藏，要麽保存在公共機構。有些水晶頭骨晶瑩剔透，有些則是煙熏水晶或彩色水晶。有的是人類頭骨大小，做工極其細致，有的則比較小，做工略粗糙。
所有這些水晶頭骨被認為起源於墨西哥和中美洲。許多人認為，這些水晶頭骨是幾千年甚至幾萬年前由壹個古老的中美洲文明雕刻而成的。也有人認為這些水晶頭骨是傳說中的亞特蘭蒂斯島的遺物，或者是外星人在西班牙入侵前拜訪過阿茲特克的有力證據。
有幾十個令人毛骨悚然的水晶頭骨讓考古學家、科學家、巫師和博物館官員著迷，並且已經爭論了100多年。
大多數關於這些頭骨的故事都集中在他們感知的超自然力量上。《水晶頭骨之謎》的合著者喬淑華？約書亞·夏皮羅在他的互聯網上引用了這些水晶頭骨的目擊者——他們認為這些水晶頭骨可以幫助治療疾病，增加他們的精神能力。
壹些人認為這些水晶頭骨是傳說中的亞特蘭蒂斯島的遺物。
“我們認為水晶頭骨是壹種計算機，可以記錄周圍產生的能量和振動，”他寫道。“這些頭骨生動地再現了與之接觸的人的所有活動或形象(也就是說，它們儲存了我們這個世界的歷史)。”
至少可以說，大多數考古學家和科學家都持懷疑態度。在古代中美洲，尤其是在阿茲特克人的藝術作品中，水晶頭骨是壹顆耀眼的明星，這些藝術作品之間存在著某種聯系，這些文明之間存在著趨同。
亞利桑那州立大學人類學教授邁克爾？邁克爾·史密斯說:“它們是繁衍的象征。這些頭骨代表了壹些阿茲特克神，因此它們可能被用來向這些神祈禱。我不認為他們可能擁有某種力量或其他魔力。”
此外，大英博物館和史密森學會最近對這些頭骨的分析表明，有跡象表明，這些頭骨可能只是現代人雕刻的藝術品。兩家博物館估計，這些頭骨可以追溯到19世紀中後期，這是公眾對古代文化表現出極大興趣的時期，當時的博物館也渴望找到古代文物進行展覽。
這項研究的結果，以及迄今為止沒有正式的考古挖掘發現任何這樣的頭骨的事實，使得大英博物館推測所有這些著名的水晶頭骨可能都是贗品。這個問題的兩面性，以及沒有人能確定制作這些頭骨的制造者和時間的事實，會引起人們的熱情。
有跡象表明，這些頭骨可能只是現代人雕刻的藝術品。
沒有人能確定這些頭骨是何時制造的。
而且，到目前為止，還沒有辦法準確確定這些無機物的年代，這個謎團可能還要後人繼續研究。但可以肯定的是，2008年，隨著動作冒險系列電影《奪寶奇兵與水晶頭骨王國:水晶頭骨王國》的上映，掀起了人們的研究熱潮。