(壹)解釋人體的組織結構
人體是壹個有機整體，根據部位和功能特點可分為陰陽。就人體部位而言，上為陽，下為陰；背部為陽，腹部為陰；體表為陽，體表為陰。根據臟腑功能特點，心、肝、脾、肺、腎為陰；膽、胃、小腸、大腸、膀胱、三焦、六腑為陽:五臟之中，有陰有陽，即心、肺在上(胸)為陽；肝腎位於下部(腹腔)，屬陰；脾最陰。如果具體到每個臟腑，可以分為陰陽，比如心有陰陽；腎有腎陰，腎陽。簡而言之，人體的上下、內外、內外、前後、五臟六腑之間，都包含著陰陽對立統壹的關系。所以《蘇文寶明全息論》說:“生命是有形的，離不開陰陽。”
(2)解釋人體的生理功能
人體正常的生理活動是維持陰陽對立統壹的和諧關系的結果，使其處於動態平衡狀態。從陰陽的角度來看，功能屬陽，物質屬陰，即精、氣、血、津液等組織結構和物質屬陰，而臟腑器官的生理功能和精、氣、血、津液屬陽。材料是功能的基礎，功能是材料的反映。兩者不僅相互對立，而且相互依存。各種功能活動(陽)的產生必然會消耗壹定的營養物質(陰)；各種營養物質(陰)的代謝必須消耗壹定的能量(陽)。正常情況下，這種陰陽的動態平衡保證了臟腑功能的健全和正常的生理活動。如果陰和不能保持相對的動態平衡，失去平衡，甚至分離，人體就會生病甚至死亡。所以說:“陰平陽為密，靈為治；陰陽相分，精絕”(《蘇文·怒天》)。
(3)解釋人體的病理變化
人類所有疾病的發生，都可以用陰陽失調來概括。所有疾病的發生和發展都依賴於正氣和邪氣。義分陰陽，包括陰精和楊琪；邪氣(致病因素)也可分為陰陽。疾病發生發展的過程就是邪與正鬥爭的過程。不管它的病變有多復雜，無非是陰陽的優劣。如果陰或陽任何壹方高於正常水平，必然導致另壹方的相對不足，即“陽勝陰病”、“陰勝陽病”、“陽勝熱”、“陰勝寒”。反之，陰或陽的任何壹方不足，必然導致對方的病，即“陽虛寒”、“陰虛熱”另外，由於陰陽互用，當陽虛達到壹定程度時，由於陽虛不能生化陰液，同時發生陰虛，稱為“陽失陰”；當陰虛達到壹定程度時，由於陰虛不能轉化為陽，同時出現陽虛現象，稱為“陰損陽”。陽損陰或陰損楊燦最終導致“陰陽兩虛”。在壹定條件下，陰失調引起的病理現象可以反方向轉化，即陰證可以轉化為陽證，陽證可以轉化為陰證。所謂“大寒即熱，大熱即寒”，“重陰即陽，重陽節即陰”(蘇文，陰陽應相象)。
(4)用於疾病的診斷。
任何疾病，雖然臨床表現復雜多變；病理變化復雜，基本機制是陰陽失調。陰陽是用來概括疾病各種證候的病理位置、性質和基本屬性，作為辨證的綱領。所以《蘇文·陰陽應象大論》說:“善診病者，望色脈象，先別陰陽。”
臨床常用的八綱辨證是各種辨證的綱領，陰陽是八綱指導表裏寒熱虛實的總綱領，即表證、熱證、實屬陽；內證、寒證、虛證都屬於陰。正確的診斷，首先必須分清陰陽，才能抓住疾病的本質，做到化繁為簡。
(五)用於預防和治療疾病。
疾病發生、發展和變化的基本機制是陰陽失調。調節陰陽是中醫治療和護理疾病的基本原則，也是陰陽理論用於疾病預防和保健的主要內容。調理陰陽就是要損其盈，補其不足，恢復陰陽的相對平衡。針對陰陽盛衰的情況，采用“瀉實”和“補虛”的方法，達到“陰陽相秘”，使陰和楊燦和諧平衡。
陰陽理論也可以用來概括中藥的屬性。藥物的屬性，包括四氣、五味、升降，都可以用陰陽來概括。藥物分寒、熱、溫、涼，寒藥屬陰，溫藥屬陽；藥物辛、甜、酸、苦、鹹，辛、甜屬陽，酸、苦、鹹屬陰。藥物有升、降、浮、沈四種作用趨勢。升浮屬陽，沈沈屬陰。在臨床治療和護理中，根據疾病的起伏，結合藥物的陰陽屬性，調整陰陽，恢復陰陽平衡，從而達到治愈疾病的目的。
陰陽學說也可以用來指導疾病的預防。善於調節陰陽，是防病取命的關鍵。維護正氣的規律要求人體陰陽的變化要與天地陰陽的變化相協調。人與自然息息相關，自然界陰陽的變化必然會影響人體陰陽的變化。如果妳善於維護陰精和楊琪，邪靈就不會入侵。中醫認為“正氣存內，邪不可為”、“邪氣合則必虛”。人是以義為本的。