根據2014年7月學校官網顯示，國家級國際科技合作基地1個，學校有部級實驗室1個，遼寧省重點實驗室11個，省級工程技術研究中心2個，遼寧省高校重大科技平臺1個，遼寧省高校重點實驗室6個，遼寧省轉化醫學研究中心4個。
國家級國際科技合作基地1個：國家級幹細胞移植與再生醫學國際科技合作基地。
部級實驗室1個：國家中醫藥管理局分子生物學實驗室（三級）。
遼寧省重點實驗室11個：醫學細胞分子生物學重點實驗室，腦疾病神經保護與損傷修復重點實驗室，糖生物學與糖生物工程重點實驗室，無特定病原體（SPF）動物重點實驗室，癌癥遺傳和表觀遺傳重點實驗室，藥代動力學與藥物轉運重點實驗室，機體微生態與疾病控制重點實驗室，中西醫結合疑難危重病基礎研究重點實驗室，腫瘤轉移幹預研究重點實驗室，腫瘤幹細胞研究重點實驗室，腫瘤生物學重點實驗室。
省級工程技術研究中心2個：遼寧省抗肝炎創新藥物工程技術研究中心，遼寧省防治老年退行性疾病天然產物工程技術研究中心。
遼寧省高校重大科技平臺1個：腫瘤幹細胞聯合實驗室。
遼寧省高校重點實驗室6個：高校腦疾病研究重點實驗室，高校癌癥基因組學重點實驗室，高校蛋白質組學重點實驗室，高校中西醫結合外科疑難危重病重點實驗室，高校藥代動力學與藥物轉運重點實驗室，高校腫瘤轉移研究重點實驗室。
遼寧省轉化醫學研究中心4個：神經系統疾病轉化醫學研究中心，肺癌轉化醫學研究中心，心血管疾病轉化醫學研究中心，腎臟病轉化醫學研究中心。 截止到2013年，學校縱向自然科學類科技項目中標338項，其中國家自然基金項目54項；***有89項科技成果獲獎，其中國家科技進步二等獎2項，遼寧省政府各級科技進步獎66項。
2003-2013年期間，學校***中標各級各類科研課題784項，其中國家級課題90項,省部級課題234項，市級及其它課題460項。承擔國家自然基金項目85項，學校***獲得各級科技獎勵254項，其中國家級2項，省部級140項，市級112項。 館藏資源
截止到2013年1月，學校圖書館藏書以生物醫學為主體，兼有多種類型、多種載體的社會科學及其他自然科學文獻。包括圖書、期刊、本校博士生和碩士生畢業論文、音像資料、多媒體光盤、光盤數據庫、電子期刊、網上數據庫等等。至2012年底，***有館藏181.23萬冊，其中電子館藏89.12萬冊。
學術期刊
《大連醫科大學報》反映多學科科研、醫療及教學的理論性學術刊物。設有基礎醫學、臨床醫學、醫學檢驗、講座與綜述、技術方法、病例報告、短篇報告，醫學教育等欄目；被中國科技論文統計源期刊所引證。