第二展廳位於博物館主樓二樓東側。六組陳列櫃用於展示良渚文化的壹些精美文物，包括雕刻精美的玉器，精細研磨的石器和制作精良的陶器。每兩組展櫃之間有壹組燈箱畫相連，並精選壹些我館不收藏的精美玉器、陶器照片。展廳中央有四組與展廳高度相同的玻璃屏風象征性地阻擋視線。每組玻璃屏風都是由兩塊玻璃組成，兩邊各有壹幅精美物品的圖片，立體感很強。這些燈箱和屏風壹方面為整個展覽營造了良好的氛圍，另壹方面擴大了展覽容量，豐富了展覽的信息。玉* * *分為兩部分，壹部分是重型禮器，包括玉琮、玉璧、玉玥；另壹部分以裝飾玉為主，包括三叉戟、冠、黃、錐、鉤、鐲、勺、匕首、掛件和鳥、龜、魚、蟬等動物飾品。在陶器部分，除了展示各種類型的陶器外，還有刻有原始文字的陶器，如單杯、橢圓豆、罐等。，特別是壹個刻有八個符號的黑陶罐，被稱為“前無古人的寶藏”在展廳的最後，還介紹了良渚遺址最早的考古學家石和良渚文化研究先驅何天星的生平事跡，以及歷年來專家學者研究良渚文化成果的部分資料。
第三展廳位於博物館主樓二層西側。它還原展示了壹座良渚文化時期的“玉蓮葬”墓，具有強烈的視覺震撼力。同時，不同等級的墓葬照片也陳列在周圍的墻壁上。通過豐富的墓葬資料的對比展示，揭示了良渚文化的社會階級分化和階級形成，對良渚文化的解讀上升到了文明的高度，整個展覽達到了高潮。
三個展廳的內容相互輝映，各有側重，充分展示了良渚先民創造的高度物質文明和精神文明，表明中華文明的起源可以追溯到四五千年前的良渚時期。
2006年，為紀念良渚文化發現70周年，23號展廳舉辦了反山瑤山玉器特展，展出600余件(組)。這是反山、堯山遺址考古發掘20年來，博物館首次展出大量精美玉器。展覽分為四個部分，從不同角度展示良渚玉的獨特內涵和功能。
第二展廳，在燈光的映射下，良渚文化的玉器散發出“雞骨白”和“南瓜黃”的獨特色彩，引人註目，蔚為壯觀。第壹部分介紹良渚社會的玉器藏禮禮制。良渚時期，玉被賦予了神聖的品格。良渚時期的三件法器:玉琮、玉璧、玉玥，高貴而神聖。它們是溝通天、地、人、神的精神物品，是神聖的器具，是維系社會等級和秩序的重要儀式物品，是世俗權力的象征。第二部分展示了良渚人精美的玉雕。良渚先民擅長切玉，形成了從原料選擇、設計定樣、切坯、紋飾雕刻到打磨的壹整套工序。礬山、堯山遺址共出土160多件神態各異、雕刻精美的玉器。它們布局合理，造型獨特，紋飾精美，都體現了良渚時期精湛的玉雕技術和獨特的匠心。面對珍貴的文物，人們都駐足壹睹其中的奧秘。那鬼斧神工，不如現代工藝美術大師。第三部分是玉的種類。良渚社會用玉的廣泛性和等級性，使玉的功能復雜化了。目前已知的種類有40多種。為了便於區分，在展覽中，我們根據出土條件和器物形狀的不同，將良渚玉器分為單件和復合件兩大類，其中復合件又進壹步分為組裝件、組裝件、佩戴件和鑲嵌件四大類。整個展板和文物相互對應，會帶給妳壹種先民精致生活的感受。
第四部分內容位於第三展廳，以復原展示的方式再現良渚文化反山遺址23號墓。這位顯貴墓出土的文物有玉器、鑲玉漆器和陶器，單件計467件。其中出土玉器54件，是良渚文化遺址中隨葬玉器最豐富的墓葬。展覽還通過墓葬規模、隨葬品數量和類別的巨大差異，生動地揭示了良渚文化時期的貧富分化和社會分層。