1，傳統思維模式沒有改變，方法運用不正確。中國中小企業擴張速度驚人。長期以來，企業壹直使用傳統的成本核算方法，因此很難從傳統的思維模式轉換到變動成本法。由於變動成本法與傳統成本法的相似性，在實際應用中容易混淆。
2.產品定價考慮不夠全面，造成偏差。變動成本法下計算的產品成本只是總成本的壹部分，即變動成本。雖然邊際貢獻的中間指標可以讓管理者直觀的看到產品的盈利能力，但是將固定成本放入期間費用中，降低了產品的成本，會導致產品定價偏低。
3.變動成本法的應用難以滿足對外財務報告的要求。變動成本法的應用會對所得稅、存貨的價值和損益的計量結果產生影響，因為變動成本法的核算是把固定成本作為期間費用計入損益，所以企業的存貨成本會降低。