1.性質不同:風景名勝區主要是人文景觀、歷史古跡，自然保護區主要是保護自然資源和生態環境。
2.側重差異:景區側重觀光，自然保護區側重保護和管理。
3.對象不同:風景名勝區的對象主要是人文景觀和自然景觀，而自然保護區的對象是野生動物和生態系統。
4.功能不同:景區的主要功能是觀光遊覽，而自然保護區的主要功能是資源保護、科學研究和生態監測。
5.管理機構不同:景區壹般由旅遊部門或建設部門管理，自然保護區壹般由環保部門或林業部門管理。
綜上所述，風景名勝區和自然保護區在性質、對象、功能、管理機構等方面都有明顯的區別。