1.業務定位不同:海通證券是傳統證券業務的主流，主要從事傳統證券業務，包括股票、基金等證券投資業務。海通創新證券是海通證券的創新分支機構，專註於互聯網證券業務和更便捷的客戶服務。
2.服務方式不同:海通創新證券主要通過網絡平臺和移動客戶端提供證券交易和財務咨詢服務，客戶可以通過互聯網和手機進行交易和咨詢。海通證券主要通過櫃臺辦理、電話委托等線下渠道提供證券投資業務。
3.技術支持不同:海通創新證券依托海通證券的大型交易系統和領先的互聯網技術，提供高效便捷的證券交易和理財服務。海通證券主要利用傳統的證券交易系統和IT技術支持。