由於手工化妝品的特點，存在明顯的缺陷，即無法保證手工化妝品的穩定性和壹致性。以手工皂為例，由於原料、工藝、技術等多種因素，小作坊手工皂的pH值很難保證，可能導致不同批次的手工皂pH值存在顯著差異。手工制作的化妝品不穩定，不壹致，對護膚不太友好。第壹次買的手工化妝品可能效果很好，但是第二次買的同樣的手工化妝品可能沒有效果甚至有負面作用。