1，管理規定不同。傳統印章管理法律法規完備，相關電子印章管理法律法規尚未頒布；
2、基於不同的防偽技術。傳統印章容易模仿，近幾年的蘿蔔印章事件都是傳統印章的負面效應；電子印章基於數字簽名技術，真正實現了防偽防篡改，不易偽造，安全性更高；
3，使用範圍不同。傳統印章適用於傳統紙質文件的蓋章，而電子印章通常只用於電子文件；
4.電子印章的法律效力在不同的使用場景下是不同的:使用普通打印機在紙質介質上打印帶有電子印章的電子文檔時，其法律效力等同於原件的復印件；當帶有電子印章的電子文件由專門控制的打印機打印在紙質介質上時，其法律效力僅限於系統內部。
5、傳統印章只能在本地蓋章，受地域限制；電子印章方便異地蓋章，節省辦公成本，提高蓋章效率。
基於此，電子印章將徹底改變人們習慣的傳統蓋章方式，成為時代的主旋律。