食藥同源的概念在現代醫學中也有應用。營養學家認為，許多藥物中的有效成分可以在普通食物中找到，並建議人們可以通過服用適當的特定營養素來預防和治療壹些疾病，如預防骨質疏松癥的維生素D和鈣，預防胎兒畸形的葉酸等等。此外，現代藥物中也加入了壹些中藥成分，如鹿茸中提取的鹿補劑，更有科學依據，為人們的健康帶來更多選擇。
同時，食藥同源也需要警惕。在保健品和藥品市場上，存在壹些違規銷售和虛假宣傳的情況，人們應該警惕無良商家的欺詐行為。更重要的是，人們不能依靠營養保健品代替藥物來治療疾病，也沒有保健品可以代替治療專業人士的治療意見。因此，食藥同源要在科學的指導下進行，拒絕過度商業化的虛假營銷。