采用關系數據庫存儲模式，其主要特點是:
(1)關系結構靈活，可以滿足布爾邏輯運算和數學運算規則形成的所有查詢需求。
(2)關系型數據還可以對不同類型的數據進行搜索、組合和比較，添加和刪除數據也很方便。
(3)其缺點是很多操作都要求在文件中按順序查找滿足特定關系條件的數據。如果數據庫很大，這個搜索過程會花費很多時間。
在土地信息系統的早期建設中，壹般采用關系數據庫來存儲管理屬性數據，而空間數據的管理多采用文件來組織和管理。壹個主要原因是關系數據庫對地理空間數據的表達能力不足；二是因為GIS軟件中的壹些數據模型和數據文件是緊密結合的。
隨著數據庫技術的發展和地理信息系統技術的廣泛應用，基於關系對象數據庫的空間數據管理技術日趨成熟，出現了統壹存儲空間數據和屬性數據的商業軟件系統。例如，Oracle數據庫系統產品Oracle Spatial支持空間數據的存儲和管理，並使用Esri的Arc SDE來管理空間數據。