陸路運輸的形成晚於水路運輸，汽車客貨運輸始於20世紀20年代。1946 10，惠南鎮-塘橋公路建成，次年竣工，滬南公路全線通車。1978南匯縣有公路241.94km，縣市區有兩線，分別是上海南和周南，相鄰縣有兩線，分別是川南和豐南。縣城和城鎮之間由公路連接，其中瀝青和水泥路面占85%以上。南匯縣有卡車1521輛，拖拉機4533輛。
20世紀南匯區高等級公路和水網縱橫交錯，每百平方公裏道路密度為118.8公裏，全長2096公裏，與上海及長三角地區的公路網和水系相連。從上海市區出發，可經南浦、楊浦、盧普等大橋和延安東路、外環、復興東路、大連路等隧道直達南匯。新建的申江南路和夏衍公路是寬闊的八車道公路。
2005年，連接上海市區和臨港新城的滬蘆高速公路將建成通車，貫穿全區的軌道交通16線、磁懸浮列車(延長線)、浦東鐵路將開工建設。到2020年，每2公裏將有壹座隧道或橋梁穿越黃浦江，市區到南匯將更加方便。大支河，河寬104米，流經南匯區，河長31公裏，為內河交通提供了優越的條件。
南匯東北有壹個國際機場——浦東國際機場，4000米主跑道1條，航站樓近25萬平方米，年客流量2000萬人次，貨郵吞吐量50萬噸。機場二期工程於2005年底投入使用，最終計劃修建4條跑道。到2010年，規劃年客流量8000萬人次，年郵運量500萬噸，成為亞太地區國際航空樞紐港。