人們制作發酵食品時，應先將材料煮熟，相當於高溫殺菌，避免雜菌汙染。然後要冷卻，防止微生物被高溫殺死，然後再接種用於發酵的菌種。用於發酵的微生物大多是厭氧的，所以發酵過程要密封，創造無氧環境，有利於微生物發酵。因此，發酵食品的生產過程壹般包括滅菌、接種、密封和發酵。
發酵食品是壹類經過有益微生物巧妙加工的食品，具有獨特的風味，豐富了我們的飲食，如酸奶、奶酪、發酵酒、泡菜、醬油、醋、發酵大豆、發酵牛奶、黃酒、啤酒、葡萄酒，甚至臭豆腐、臭冬瓜等。這些都很吸引人，主要包括谷物發酵制品、豆類發酵制品和乳類發酵制品。
發酵饅頭和面包比蛋糕和面條等非發酵食品更有營養，因為使用了酵母。實驗表明，酵母不僅改變了面團結構，而且使其更加柔軟可口，大大增加了饅頭和面包的營養價值。
發酵食品富含蛋白質實驗，證明酵母富含維生素、礦物質和酶。每1公斤幹酵母含蛋白質，相當於5公斤大米、2公斤大豆或2.5公斤豬肉的蛋白質含量。所以饅頭和面包的營養含量比餡餅和面條高3-4倍，蛋白質高近2倍。