油氣信息室:負責國家油氣資源數據庫和管理系統的建設、維護和管理；組織編制油氣資源數字地圖；跟蹤研究世界主要產油國和石油公司的戰略變化，及時提供相關信息。
發展戰略研究室:分析預測國內外油氣資源戰略形勢；開展國內外油氣資源發展戰略和重大問題對策研究；開展國內外油氣資源管理體制、運行機制、政策法規研究。
戰略選區研究室:分析國內外油氣資源調查勘探現狀，研究油氣資源潛力；開展中國油氣資源遠景選區論證，為實現中國油氣資源重大發現和突破提供建議；研究論證油氣資源“走出去”的戰略選擇區域，提出政策建議。
科技與市場研究室:跟蹤國內外油氣資源新理論、新技術、新方法的發展動態，提出促進科技進步的政策建議；對國內外油氣資源市場進行動態跟蹤分析；開展油氣資源技術和市場的綜合和專項研究工作。
油氣礦權事務辦公室:負責油氣資源探礦權采礦權初審的技術性和事務性工作，以及油氣礦權檔案管理，接受國土資源部地質勘查司的指導。
礦產儲量研究室:承擔礦產資源儲量管理的技術性和日常性工作，業務工作受國土資源部礦產儲量司指導。
礦產開發研究室:承擔礦產資源開發管理的技術性和日常性工作，業務工作受國土資源部礦產開發司指導。