(1)打印速度慢。
效率就是金錢，印刷的速度很大程度上關系到企業的效益。目前最快的數碼噴墨印花機的打印速度可以達到150m2/h，但與傳統印花機相比還有很大差距，需要進壹步提高。
(2)油墨成本比較高。
數碼噴墨印花雖然不需要制作絲網，但在少量生產的情況下，總成本低於傳統印花，而且所用油墨的價格遠高於傳統印花所用的染料和顏料。因此，超過壹定的印刷長度後，油墨價格會帶動數碼噴墨印刷的成本超過傳統印刷。在未來，墨水的價格需要合理調整，以促進數字噴墨打印的發展。
(3)新舊技術的結合。
隨著數碼印刷技術的不斷提高，噴印的速度也在加快，但要趕上傳統印刷機的速度還有很長的路要走。因此，采用省時的數碼印花機進行打樣或小批量生產，再配合傳統印花機進行大批量生產，將是未來紡織印花行業的基本組合模式。但新舊技術結合仍存在問題，需要進壹步突破。
(4)色彩準確度
相對於傳統印刷的專色印刷，即每組顏色單獨用色漿混合，通過電腦測色配色系統可以達到很高的色彩準確度，即使壹個色漿出現偏差，也只是影響壹組顏色。數碼印刷是CMYK混色印刷，所有顏色都用四色油墨混合。壹點點外界的影響，比如油墨的差異，打印頭的差異，打印環境的細微變化，都會影響混色後壹系列顏色的準確性。所以數碼印刷的色彩精度比傳統印刷稍差。