藥材的加工方法有多種，由於藥材類別的不同或相同藥材因產地不同其加工方法也有差異。常見的加工方法有：
1、揀、洗將采收的新鮮藥材除去泥沙雜質和非藥用部分。
2、 切片 較大的根及根莖類、籐木類和肉質的果實類藥材大多趁鮮切成塊、片，以利於幹燥。
3、熏、煮、燙含漿汁、澱粉或糖分多的藥材，用壹般方法不易幹燥，須先經熏、煮或燙的處理，則易幹燥。
4、去殼 種子類藥材，壹般采收果實後曬幹去殼，取出種子，或先去殼取出種子而後曬幹。
5、 熏 有些藥材為保持色澤潔白，防止黴爛，常在幹燥前後用硫黃熏制，如山藥等。
6、發汗 有些藥材在加工過程中，需堆放起來發熱、"回潮"，使其內部水分往外揮散，變軟，變色，增加香味，有利幹燥。這種方法稱發汗"。
7、幹燥 幹燥的目的是及時除去新鮮藥材中的大量水分，避免發黴、蟲蛀以及有效成分的分解和破壞，保證藥材質量，利於貯藏。根據藥材的性質不同，常用幹燥的方法有曬幹、烘幹、陰幹或冷凍幹燥。
8、撞 有些藥材為了除去須根、泥沙、粗皮等，在經幹燥後將藥材裝入特制的撞籠在麻袋中進行撞擊加工。
9、揉搓 壹些藥材在幹燥過程中易皮肉分離或空枯，為丁使其達到油潤、飽滿、柔軟的目的，在幹燥過程中必須進行揉搓。如黨參、麥冬等。