跨國公司在設計其組織模式時，需要考慮許多影響因素，如企業知識產權戰略、專利技術發展、企業生命周期、環境因素、企業規模和組織與當地文化，以及組織的管理傳統和歷史發展。以美國、歐洲和日本的跨國公司為例，由於管理傳統和歷史發展的原因，它們的組織模式具有不同的特點。
歐洲跨國公司分散財團。歐洲企業在前期實施國際化戰略時，發現其目標市場所在國的地方政府往往被迫采取針對跨國公司的高關稅和歧視性法律來保護國內市場。為了改變這種不利局面，跨國公司往往在當地設廠，給予當地子公司很大的自主權，依靠當地子公司改進產品和營銷方式，以滿足當地市場的需求。這樣最終形成壹個由獨立的地方子公司組成的松散聯合體，各子公司主要關註各自的地方市場。
美國跨國公司的聯合財團。在國際化過程中，美國公司采用了與歐洲跨國公司不同的組織模式。因為美國公司大多傾向於分權管理，同時整體上受復雜的管理系統和專家控制，公司總部控制著公司的業務信息，所以公司高層可以控制這些自由運作的獨立子公司，引導其發展方向。同時，雖然國外子公司經常自由改進產品和策略以反映市場差異，但它們對母公司新產品、程序和理念的依賴決定了它們比分散的聯合體更容易被總部協調和控制，這就產生了美國式的協調聯合體。
日本的集權管理模式。當日本公司在上世紀70年代進行國際擴張時，他們采取的策略是不在歐美競爭對手擁有優勢的市場上競爭。他們主要通過其全新、高效、規模化的工廠開拓國際市場，利用成本優勢和質量保證，對產品開發、采購和制造實施嚴格的集中決策和控制措施。正是在這種背景下，日本企業傾向於選擇集權管理的組織模式。
通過對上述組織模式的比較分析，可以發現全球產品結構的主要收益是效率的提高，而全球區域結構的主要收益是對當地市場的及時反應。然而，當跨國公司要求本土單位具備對本土市場的敏銳反應能力、有效利用全球規模經濟的能力和強大的全球學習能力時，傳統的國際事業部結構和全球職能結構顯然無法滿足這壹要求，於是壹些企業嘗試采用壹種新的組織模式——跨國網絡組織結構。如ABB、聯合利華、寶潔、飛利浦。網絡組織借用了神經生理學和計算機科學中的網絡概念，是壹種基於信息技術應用的新型組織形式。目前，學術文獻對網絡組織沒有明確統壹的定義，但筆者認為，網絡組織是以IT為工作平臺，以企業與社會組織之間、企業內部各職能單位之間在跨界資源整合過程中形成的各種經濟聯系為紐帶，通過活動節點連接起來的協同系統。跨國網絡組織是跨國公司內部和外部單位之間基於某種機制形成的網絡組織。它在全球範圍內將企業劃分為許多不同類型的中心或業務單元，用自由市場模式取代傳統的垂直層級組織，按照“柔性集權”的原則運作。
如上所述，企業在國際化過程中可以采用的基本組織結構主要有跨國母子公司結構(出口部或國際業務部)、全球職能結構(全球區域結構、全球產品結構和全球矩陣結構)和跨國網絡結構，這些組織結構各有不同的特點和適用條件。
跨國公司的各種組織模式各有利弊，也有不同的適用條件和範圍。企業在設計組織結構時，需要綜合考慮各種影響因素。壹般來說，跨國母子結構更適合於對全球戰略和本土戰略重視程度不高的國際化經營初期；全球區域結構能有效滿足“全球思維，本地行動”的戰略要求；全球化的產品結構具有更強的全球視野；全球矩陣結構主要是壹種過渡結構，在企業實踐中效果不理想；隨著信息技術和知識管理的發展，當企業對全球戰略和本地戰略有較高要求時，跨國網絡結構往往成為理想的選擇。跨國網絡組織具有更強的靈活性、適應性和競爭力，也代表了跨國公司組織設計的未來發展方向。