藥物治療主要包括非甾體抗炎藥、糖皮質激素、抗風濕藥物等來改變病情。其他輔助療法可應用於某些疾病。
(1)非甾體抗炎藥(NSAID)；
臨床上作為對癥藥物廣泛用於改善風濕病的各種關節腫痛，但不能控制原發病的進展。經過壹百多年的發展，已有數十種不同化學結構的制劑。現在已知各種NSAID具有相同的鎮痛抗炎機制，即抑制組織和細胞中環氧化酶(COX)的產生，減少COX介導的炎癥介質——前列腺素。90年代發現COX有兩種同工酶，分別是COX-1和COX-2。在生理條件下，COX-1和COX-2可以在人的腎臟、大腦、卵巢等組織中同時表達。COX-1主要在胃黏膜中表達，在血小板中僅發現COX-1。COX-2產生的前列腺素主要存在於炎癥部位，導致該組織的炎癥反應，產生腫脹、疼痛和發熱。因為NSAID可以同時抑制COX-1和COX-2，抑制COX-2可以達到抗炎鎮痛的作用。抑制COX-1後，會出現胃腸道不良反應，嚴重時甚至會出現潰瘍、出血、穿孔。腎臟COX-1被抑制後，水腫、電解質紊亂、血壓升高，嚴重者出現可逆性腎功能不全。為了減少非甾體抗炎藥的胃腸道不良反應，選擇性抑制COX-2的非甾體抗炎藥塞來昔布於20世紀末問世。選擇性COX-2抑制劑的療效與傳統NSAIDs相似，對腎臟的不良反應與傳統NSAIDs相似，但胃腸道反應減少。由於高選擇性的COX-2抑制劑對COX-1產生的血栓素無抑制作用，可能存在血栓形成的不良反應。壹些研究報告表明，這種藥物會增加心血管事故的發生。相關學者正在對此進行仔細觀察和研究。在臨床上使用這種藥物時，特別是對於老年患者，我們應該非常謹慎，並密切隨訪。
(2)糖皮質激素(簡稱激素):是治療各種CTD的壹線藥物，但不是根治藥物。它具有強烈而迅速的抗炎作用，通過受體發揮作用，其中壹個受體位於中樞神經系統，調節這種激素的晝夜活動，另壹個受體位於體內各種細胞，具有抗炎和代謝調節作用。激素與細胞質受體結合形成受體復合物時，進入細胞核與染色質結合，改變細胞合成的蛋白質性質，如抑制核轉錄因子κB(NF-κB)，減少炎癥細胞因子等。激素可抑制巨噬細胞吞噬和抗原提呈，減少循環淋巴細胞和NK細胞數量，對產生抗體的成熟B細胞抑制作用不大，說明激素主要抑制細胞免疫。
激素制劑很多，其中可的松和氫化可的松半衰期短，潑尼松和甲潑尼龍半衰期中等，地塞米松半衰期長。雖然激素是壹種強效消炎藥，廣泛用於CTD，但不良反應較多，尤其是長期服用者。不良反應包括感染、高血壓、高血糖、骨質疏松、停藥反跳、股骨頭無菌性壞死、肥胖、精神興奮、消化性潰瘍等。在臨床應用中，必須掌握適應癥和藥物劑量，並監測其不良反應。
(3)病情變化抗風濕藥物(DMARD):指能預防和延緩RA關節骨結構破壞的藥物。它是壹組化學結構不同的藥物或生物制劑，特點是起效慢，停藥後消失慢，故曾被稱為慢作用抗風濕藥物。現在納入這壹組的生物制劑起效快，稱之為慢作用抗風濕藥物不合適。
該組藥物可通過抑制淋巴細胞(抗瘧藥除外)來緩解RA或其他CTD的病情，但不能消除低度免疫炎癥反應，因此不是根治性藥物。
除了原有的DMARD，近年上市的生物制劑，如TNF-α和IL-1的拮抗劑、抗CD20單克隆抗體等，具有特異性的“靶標”拮抗作用，可以阻斷免疫反應中的某壹環節而生效，是未來治療風濕性疾病的重要發展方向之壹。對生物制劑應用的擔憂有:①價格昂貴，不宜廣泛使用；②對長期應用後的長期療效和不良反應缺乏了解和總結。
(4)輔助治療:靜脈註射免疫球蛋白、血漿置換、血漿免疫吸附等。，有壹定療效。因其價格昂貴，無法與上述三種主藥分開，可用於有壹定適應癥的風濕病患者。
除上述藥物外，還要註意對風濕病患者及其家屬的教育，消除其心理障礙，進行康復訓練。