在中國，很多本來是制度層面的問題往往被消解為道德問題，因而長年累月得不到解決，因為道德問題是不可控的。慈善所面臨的困境也是如此：某些個人和團體的道德敗壞是很難完全避免的，所以在義憤填膺地譴責之後，貪汙和挪用卻屢禁不絕。如果身處壹個不要監督、沒有競爭，只講“良心”、只講“思想教育”，只講“自我批評”和“自我監督”的環境，將沒有任何機制可以防範如此勾當的發生；換句話說，這種行為的出現將是不可避免的。
其實，中國大陸的慈善事業有著悠久的傳統。漢唐寺院濟貧、賑災、醫療、戒殘殺的長盛不衰；宋代養老扶幼事業的勃興；元醫療救助的興起；明清民間慈善群體在中國慈善史上也首屈壹指。中國幾千年傳統文化孕育了大量弘揚慈善精神的經典篇章。
1949年之後，原來的救災、扶貧等壹些社會福利性工作，基本上是由民政系統的各部門在做，社會慈善事業在壹段時間內基本上屬於空白。到了1990年代，隨著改革開放的進壹步深入，為了和國際接軌，國內相繼成立了壹些非營利性的慈善機構。這些機構的成立，在壹定程度上填補了國內在這壹方面的空缺。其中壹個最大的瓶頸，就是目前國家慈善事業的壟斷機制。慈善機構門檻太高，審批手續（政府部門主管）和註冊原始基金（公募與私募基金會分別為800萬與200萬）是壹道難以逾越的鴻溝。目前，中國內地正式註冊的慈善基金會只有幾百家，而只有中華慈善總會與中國紅十字會等7家慈善機構是捐贈全額免稅的慈善組織。也就是說，只有極少數慈善機構獲得了政府的特別許可，有權開出能得到政府財政部門認可的捐贈證明，因此捐贈者的選擇範圍非常狹小。這顯然很難適應活躍的公民社會。
絕對權力絕對產生腐敗，這句話不但適用於政治領域、也同樣適用於社會公益領域。慈善通道不夠透明，讓人們無法追蹤每壹筆款物的流向；慈善組織沒有獨立法人的地位，無法承擔獨立的民事責任，無法追究其民事訴訟責任；慈善機構必須要有主管單位，這使得其容易受到上級主管者的幹預，不排除會出現行政指令挪用款項的現象。
2007年，北京市紅十字會緊急救援中心副主任邸傑，因職務侵占、貪汙、受賄等被朝陽法院判處有期徒刑12年；
2004年，審計署在對紅十字總會進行審計時發現，2003年至2004年，中國造血幹細胞捐獻者資料庫管理中心將財政部撥付的用於檢測項目的彩票公益金購置小轎車、旅行車63.31萬元，列支辦公用房租金59.61萬元；
2003年至2004年，中國紅十字會總會未經批準向有關單位收取使用紅十字標誌掛牌費、管理費80.73萬元；
2000年至2004年，所屬機關服務中心在賑災物資采購中向供貨單位收取“服務費”778.93萬元，且未納入財務賬內統壹核算，形成賬外賬；
2003年至2004年，中國造血幹細胞捐獻者資料庫管理中心向白血病患者收取“檢索相合費”和“管理服務費”81.99萬元。
目前很多慈善機構不樂意把自己的賬目公布，因為壹公布便有問題存在。比如說工作做得不是很多，但是雇了很多人，花在工資、房租、水電上的錢很多。這樣壹來，別人就不願意給他們捐錢，而國家也沒有規定慈善機構壹定要公布賬目。在國內的慈善機構裏，有提取不到10%管理費的，也有高達60%多的，但在年檢時，後者壹樣過，並無分別。
慈善機構是沒有利潤的，而做事是需要成本的，所以重點不在於提取多少管理費，而是這些錢用在了什麽地方，是否透明公開。國內的情況是，紅十字會和慈善總會等機構，壹方面按照公務員管理，有政府劃撥的經費，另壹方面又提取管理費，而且不對外公布賬目，人們自然會有不滿。
汶川地震後，越來越多的基金會開始註重透明度，因為“公眾意識已對慈善體制構成有效監督”。以往，幾乎“壟斷”著慈善界的幾家“龍頭”基金，往往只公布“收”，不公布“支”。而此次，針對西南大旱捐贈，中國紅基會在自己的網站上分批公布了已撥出的超過2000萬元捐贈的使用方向，並特別註明“受助對象在領取時，要嚴格履行登記、簽字手續”，以便“進行網上公示和向捐方反饋”。
汶川大地震後很多人帶著壹腔熱血和大量物資來到四川，卻發現有力使不上，不得要領，不知道如何和官方以及其他組織進行協作和對接。這就牽涉如何對慈善事業進行協調和管理的問題。提起慈善，人們往往想起的是扶危救困、善良和同情心，很少意識到做好事也需要效率和管理，也需要專業知識和高素質的人才。
在西方發達國家，公益組織的運作是具有相當高技術含量的工作，其復雜程度絲毫不亞於商業公司，同樣也追求“投資回報率”。因此在西方，將商業領域的管理方法和技術引入慈善事業，擺脫以往的“施舍性質的濟貧院方式”，以投資來解決根本問題，進而凸顯自由、個人價值以及企業精神早已深入人心。
哈佛商學院的管理學大師邁克·波特認為，由於管理不善或者花錢不善，人類浪費的善款不下數十億美元，很多慈善活動根本就沒有什麽效果。為了改變這種現象，波特認為慈善活動應該向商業活動學習，很多慈善家已經在談論“投資”、“風險慈善”、“市場導向”等術語，這些詞原本屬於商業領域的概念。只有引進這些概念，慈善才會變得更為有效。
因此，很多成熟健全的非營利組織，其運作與商業組織無異，甚至也會開展壹些“賺錢”的經營活動。2004年蓋茨基金會就被中國證監會批準成為中國股市的合格境外投資者，或許蓋茨基金會現在已經持有了多家中國公司的A股股票。但是它的賺錢和盈利組織的本質區別在於：所獲得的收益必須被運用於公益的用途，而不是用於投資者的分紅。而蓋茨基金會的CEO帕蒂，過去是微軟的壹員大將，負責2000多人的互動媒體部門的運作。而在中國，官方慈善機構往往成為官員退休之後的安置場所，很少有人意識到對慈善進行有效管理以及培訓、學習的重要性。
因此，國內的慈善機構應該從此次捐款中看到效率和專業化對於“做好事”的重要性，改變過去只憑壹腔熱情就能做慈善的刻板印象。顯然，花錢和賺錢壹樣需要智慧和能力，慈善是壹門專業。