中醫是中華民族傳統文化中的瑰寶，也是世界醫學的壹枝獨秀。中醫的基本理論體系深受古代唯物主義和辯證思維的影響。是以整體觀為主導思想，以臟腑經絡生理病理為基礎，以辨證論治為基礎的醫學理論體系。
中醫理論整體觀
中醫理論從誕生到發展，充滿了樸素辯證唯物主義的原創思想。中醫理論強調人與自然和諧的整體觀，這是中醫理論的基礎，也是古代唯物主義和自然辯證法在中醫中的體現。它貫穿於中醫生理、病理、診斷、辨證、治療的整個理論體系。中醫整體觀強調人體內外環境的整體和諧、協調、統壹。中醫理論的形式特征是辯證邏輯。與西醫的形式邏輯相比，中醫的辯證客觀邏輯是與人體的復雜性相統壹的。從治療理念和思維原理來看，西醫主要治療“人的疾病”，而中醫理論的思維強調以人為本，重在治療“有病的人”。在中醫理論體系中，人既是自然人，又是社會人，講究“治標治本”，註重內在機理和能力，主張“形神合壹”、“調神”，把調養精神放在上面。
比如《黃帝內經》的整體觀:“十二官互不可失，所以主政時安……”，說明人體各器官之間的相互聯系和制約是在“神”(心，即腦)的統壹支配下有機地聯系在壹起的，把人體各器官之間的關系及其結構和功能之間的關系作為壹個整體來觀察。《內經》論述了人體外部與內部、部分與整體的密切關系。局部疾病會影響全身，全身疾病也會影響局部。同時，人體與自然環境的變化有著密切的關系。
中醫理論中的本質與現象
本質是事物的內在規律，現象是事物本質的外在表現。本質是內在的、決定性的、相對穩定的，現象是外在的、豐富生動的、多變直白的。本質決定現象，現象是起源，現象表現本質。本質和現象是矛盾統壹的，在壹定條件下可以相互轉化。現象可以通過人的感官直接感知，而本質則需要通過對現象的抽象思考來把握。科學的任務是通過觀察事物的現象來理解事物的本質。
中醫的理論是建立在事物本質和現象的關系上的。人體的生理現象、臨床表現和對治療的反應都是人體外的現象，可以直接感知。中醫在分析總結各種現象的基礎上，認識人體生理病理活動的本質，產生抽象的形象。中醫這種通過外在的生物和病理現象來了解人體本質特征的研究方法，不像現代醫學對人體的觀察那樣直接、具體、細致，但沒有副作用和痛苦，簡單易行。
既然本質是事物發生發展的決定性因素，那麽理解和解決事物就要以本質為目標。中醫“治未病”的指導思想是對事物本質和現象關系的深刻認識，是解決疾病問題的根本。從壹個側面說明了中醫學與唯物辯證法的密切關系。
中醫理論與對立統壹規律
“陰陽學說”是哲學中對立統壹規律在中醫學中的具體應用。《內經》說“生命是有形的，離不開陰陽”構成了壹個對立統壹的整體，兩者是矛盾對立又相互依存，互為根源又相互轉化的。陰陽的這些特性，就是哲學上的對立統壹規律，構成了人體，維系著人的生命活動。生理狀態下，陰陽相對平衡，病理狀態下，陰陽失衡。人體在陰陽不斷變化、不斷失去平衡、不斷達到新的平衡的過程中，完成長大和老死的生命活動。這和對立規律推動事物發展的哲學觀點是完全壹致的。
在中醫認識人體生理病理的模式中，是人體內部陰陽對立統壹的運動決定了外在的生理病理現象，或者說人體外在的生理病理現象反映了陰陽對立統壹的運動。人體是陰陽對立統壹的。構成人體的各種物質都屬於陰，構成人體的組織、器官和其他物質成分。由此產生的生理功能屬於陽，不斷促進物質的代謝。屬陰的物質體是屬陽的生理功能的基礎，生理功能賦予物質體生命活動。它們既矛盾又相互依存。人體生長發育的過程體現了陰的不斷增長，與之相伴隨，陽也同步增強。人類衰老死亡的過程就是陰的過度分解破壞，陽的逐漸衰弱。這是人類生命的自然過程，標誌著人體陰陽的相對平衡，即“陰陽之秘”。
簡而言之，中醫通過人體外部的生物和病理現象來理解人體內部的陰陽平衡或盛衰變化，而這種陰陽平衡正是對立統壹的矛盾規律的表現。