然而，目前校園體育文化建設長期受到傳統人才培養理念的影響。在日常教學中，往往偏重學生的技能和理論水平，沒有全面加強人文知識和人文精神的教育和培養。校園主要以專業教育文化和組織文化為主，體育文化、藝術文化等領域往往被忽視甚至邊緣化，為了完成相關規定動作而被動機械地進行。
這些都不利於校園體育文化建設的發展和校園體育精神的培養。另外，目前很多學校在體育理論課的教學中，主要滿足於常規的課堂教學，沒有為學生提供更多前沿的體育人文知識和體育健康知識，不利於激發學生的學習興趣，開發學生的體育潛能。某種程度上難以促進校園體育文化潛在的人文素質教育力量的不斷提升，也不利於大學精神久而久之的傳承和創新發展。
目前，校園體育文化建設在物質方面缺乏整體規劃和設計。加強校園體育文化建設，需要通過可視化展示系統進行可視化管理，為學生提供更多實踐和應用探索的平臺。
雖然與學校體育文化建設相關的設施配置水平在不斷提高，但也應該看到，與校園體育文化物質層面相關的設計和規劃缺乏深度，沒有結合學校的發展定位和師生體育需求對資源要素進行統籌規劃和配置。很多體育場館缺乏美觀性、人性化、利用率、科學性。如何加強校園體育文化的物質體系建設也成為校園體育文化建設的難點。
目前，校園體育文化建設還沒有實現多樣化和規範化的有機統壹。校園體育文化體系的建設也涉及到校園行為文化體系的建設。目前校園行為文化比較缺乏。壹方面，校園相關的體育社團數量比較少，形式比較單壹。體育社團活動主要是圍繞體育活動、比賽、體育休閑活動等組織的。很多學校沒有結合自身實際和中國特色，打造校園體育社團等活動的特色，甚至只是被動地參加上級組織的各種體育比賽。
另壹方面，校園體育社團管理不規範，成立體育社團或其他相關社團的程序較為簡單，沒有完善規範的審批流程，相關經費不足，沒有健全完善的體育管理制度，壹定程度上不利於校園體育文化的長遠發展和特色發展。此外，校園體育文化建設需要加強機制建設和規章制度的建立，從而更好地促進校園體育文化建設的持續有序發展。
然而，目前校園體育文化建設還存在許多問題。由於不同領導對校園體育文化建設的理解和重視程度不同，發展理念不同，會采取不同的政策，校園體育文化體系建設沒有完善、科學的規範體系，導致校園體育文化建設的短期工程或形象工程。
目前，校園體育文化建設的特色功能尚未得到有效發揮。目前，在校園體育文化建設過程中，往往更多地關註物質文化和行為文化的淺層意義，沒有對體育精神文化、學校體育發展特點和學科特點進行深入研究來構建體育文化體系，導致體育文化建設逐漸同質化，沒有明顯的中國特色和學校特色，影響了體育強校的發展。
總結分析校園體育文化建設中存在的問題。壹方面，由於傳統教育的缺失，體育文化在傳統觀念中不足以承擔民族的脊梁，所以容易被忽視，不被重視。此外，我國高等教育發展時間短，側重於教學、學生管理、人才培養等顯性指標的實現，在校園文化建設的內涵挖掘、文化模式構建等方面，沒有探索出科學可行的發展路徑。
另壹方面，受長期應試教育觀念的影響，雖然素質教育實施已久，但很多人頭腦中對體育文化等方面的重視仍然不夠，很多學生對體育缺乏正確全面的認識。如何調動學生參與校園體育文化建設的積極性，已經成為壹個應該考慮的重要問題。
另外，社會變遷導致文化多元，壹些學生的價值觀必然會受到影響。教育規模的不斷擴大也對校園體育文化建設提出了新的要求和更高的挑戰，這也是影響中國特色校園體育文化建設的重要因素之壹。