1.向有關國家機關申請專利或者保護商業秘密。自制黑膏藥其實是壹項發明，可以向國家有關機關申請專利。
2.改進銷售程序。銷售自制黑膏藥也是市場行為，要積極辦理銷售手續。
3.把專利賣給大藥廠，簽合同的時候可以要求利潤分成。國家對藥品生產、銷售設定了行政許可，未按照法定程序取得相應資質和許可，屬於輕微行政違法，屬於嚴重犯罪。只有具備合法銷售資質的廠家才能保證商品順利銷售。只有這樣，合格的膏藥才能安全合法的銷售。
4、加強秘方保護的法律建議。為了防止自制秘方被他人非法竊取，可以咨詢司法機關，依法保護祖傳秘方。
5.進行合法廣告宣傳。自制黑膏藥的廣告必須真實可信。千萬不要做虛假宣傳。
法律依據:
《藥品經營質量管理規範》
第七條
質量管理部門應當履行下列職責:
(壹)督促有關部門和崗位人員貫徹執行藥品管理法律法規和本規範；
(二)組織制定質量管理體系文件，並指導和監督文件的實施；
(三)負責對供應商、采購方的合法性、采購藥品的合法性、供應商、采購方銷售人員的合法資格進行審核，並根據審核內容的變化進行動態管理；
(四)負責質量信息的收集和管理，建立藥品質量檔案；
(五)負責藥品驗收，指導和監督藥品采購、儲存、養護、銷售、退貨、運輸等環節的質量管理；
(六)負責不合格藥品的確認，監督不合格藥品的處理過程；
(七)負責藥品質量投訴和質量事故的調查、處理和報告；
(八)負責假劣藥品的舉報；
(九)負責藥品質量查詢；
(十)負責指導計算機系統質量控制功能的設置；
(十壹)負責計算機系統操作權限的審核和質量管理基礎數據的建立和更新；
(十二)組織相關設施設備的檢定和校準；
(十三)負責藥品召回管理；
(十四)負責藥品不良反應的報告；
(十五)組織質量管理體系的內部審核和風險評估；
(十六)組織對藥品供應商和采購商的質量管理體系和服務質量進行檢查和評價；
(十七)組織對委托承運人的運輸條件和質量保證能力的審查；
(十八)協助開展質量管理教育和培訓；
(十九)其他應由質量管理部門履行的職責。
藥品管理法實施條例
文章
開辦藥品生產企業，申請人應當向擬開辦企業所在地的省、自治區、直轄市人民政府藥品監督管理部門提出申請。省、自治區、直轄市人民政府藥品監督管理部門應當自收到申請之日起30個工作日內，根據《藥品管理法》第八條規定的啟動條件組織受理；檢驗合格的，發給《藥品生產許可證》。