藿香正氣水是中成藥，以前有丸劑，現在有軟膠囊。主要成分為廣藿香、茯苓、大腹皮、紫蘇葉、白芷、陳皮、桔梗、白術、厚樸(姜制)、法半夏、甘草等。功能化濕、理氣和中。用於外感風寒、內傷濕滯、頭痛眩暈、脘腹脹痛、嘔吐泄瀉等癥。近年來，通過臨床實踐，發現了新的外用療效，特別是對皮膚病。
現代醫學認為頭癬、手足癬、灰指甲是由皮膚真菌感染引起的，而藿香、紫蘇、白芷、桔梗分別對多種病原真菌有較強的抑制作用，因此在臨床上對頭癬、手癬、灰指甲有很好的療效。用藿香正氣水擦患處，1-2次，壹天壹次，有條件的壹天擦幾次。
中醫疔瘡壹般分為暑癤和多發性癤病，認為是濕熱內蘊、血熱或外感風熱、暑邪所致，現代醫學認為是葡萄球菌感染所致。方中的紫蘇等成分有抑制葡萄球菌的作用，方中的藿香芳香化濕；白芷能祛風勝濕，故能解郁祛濕治疔瘡癤腫。使用方法:用棉簽蘸藿香正氣水，每日數次摩擦患處。
中醫認為白癜風是由於風濕侵入毛孔，導致氣滯血癌，發竅閉塞所致。而藿香正氣水有芳香開竅，行氣的作用。氣屬帥血，氣則行血，行血則瘀。其用法是每天用幹凈的布蘸取藿香正氣水輕輕用力摩擦患處，反復浸洗至皮膚泛紅，每日兩次。
外陰瘙癢由於藿香正氣水由藿香、紫蘇、白芷、生姜等抵抗多種致病菌和殺滅滴蟲的藥物組成，對外陰瘙癢有很好的療效。用法:用藿香正氣水1g: 50g拌涼開水洗外陰，男女皆可。不僅有止癢的效果，還有清爽的感覺。因此，藿香正氣水的稀釋溶液也可以作為性器官的健康清洗劑。
外痔每次用藿香正氣水2片，冷開水1000ml，用藥棉擦洗，每天兩次。在炎癥發作時有消炎、止痛、促進萎縮的作用。