會計信息系統的建設和運行是實現會計工作良性發展的必要措施。首先，企業高層要加強認識，改變對會計信息系統的傳統認知觀念，認識到會計信息系統的建設和完善是提升企業核心競爭力的重要手段，能夠促進企業的全面、可持續發展。而且單位業務部門負責人要將會計信息化工作加入到企業信息化工作中，針對現狀和問題制定信息化建設發展規劃，將資金管理系統、成本系統、財務系統有效結合起來，促進更加完善的管理和實施。
2.加強會計人才隊伍建設。
人才在會計信息化中的作用越來越重要，高素質的人才決定企業的發展。因此，企業應不斷加強專業人才的培養。首先要完善制度建設，結合國外成熟的知識和技術，完善核算機制，取長補短。其次，要加強專業從業人員的技能培訓，定期組織從業人員學習專業會計技術知識，不斷提高專業素質，增強計算機系統應用能力，加強管理，促進會計信息系統更加完善的運行和實施。
3.建立和完善內部控制制度
會計信息系統內部控制制度能夠有效保護財產的安全和完整，保證會計信息數據的可靠性和有效性。因此，必須加強內部控制制度建設，保證國家有關政策、方針和單位制度的貫徹執行，結合系統內部分工形成壹套行之有效的管理控制措施，完善管理制度，提高數據的準確性，保證會計信息的安全和完整。
4.加強會計信息系統的風險控制
會計信息系統存在服務器硬件故障、數據泄露、黑客入侵等風險，在管理上應做好控制。首先，我們需要建立壹個完善的基於硬件的安全風險控制體系，比如設置壹個硬件防火墻，部署防火墻工具；啟動備用機，實現定時自動備份；建立機房硬件服務器的安全防護體系。同時，要建立以軟件為核心的風險控制體系，企業要嚴格控制賬戶使用權；實施數據加密，避免數據完整性被破壞；限制IP以提高安全性能；給每個崗位分配具體的責任，建立有效的責任制，進行全面的預防。