差異:
首先，使用的計算工具不同
手工核算使用的計算工具有計算器等。
電算化會計使用的計算工具是電子計算機和壹些輔助設備。
第二，數據載體不同
人工核算的所有信息主要基於紙面。
會計電算化的數據載體除必要的原始憑證外，還可以使用磁介質作為會計憑證和賬簿的信息載體。
三、帳簿的形式和糾錯方法不同
手工會計規定總賬使用日記賬，明細賬可以使用活頁本；賬簿中記錄的差錯，應當用劃片更正或者紅字更正。
會計電算化打印的賬頁呈條狀，可裝訂成活頁式，作為會計檔案保存；在電算化會計中，必須對輸入的數據進行邏輯檢查(如會計科目的邏輯檢查和貸款金額的余額檢查)，所以不壹定要用交叉更正法改變賬簿記錄。如果賬簿記錄有問題，那壹定是法律問題，經常用輸入的“更正憑證”進行更改，類似於紅墨水更正的方法，以便留下更改的痕跡。
第四，會計程序不同
手工會計人員在處理會計數據時，根據會計業務的復雜程度和管理需要選擇其中之壹，規定憑證、賬簿、報表之間的關系，以及如何記賬。但無論采用何種方式，重復抄收的根本弱點是不可避免的，伴隨而來的是會計人員和處理環節的增加，而不加強內部牽制和相互核對，必然導致錯誤和舞弊。
在會計電算化處理中，整個處理過程分為輸入、處理和輸出三個環節。其控制的重點是輸入這個環節，從會計憑證的輸入到會計報表的輸出，壹氣呵成。所有中間過程都在機器中操作，肉眼看不到，任何需要的中間信息都可以通過查詢得到滿足。
動詞 （verb的縮寫）科目設置方式和賬簿登記方式的區別
手工核算時，應針對會計的六大要素設置資產、負債、所有者權益、利潤、收入、費用等六大類科目，並設置總分類賬和不同的明細分類賬。
在電算化會計中，設置賬戶被定義為:為了在未來獲得某種信息，預先設置壹個塑造這種信息的模型(也叫房間)。所有賬戶都有壹個賬號(房間號)。本科目編號的*9位表示本科目的大類，前三位表示總賬的科目，便於進行總賬、明細賬、日記賬等各種處理。
六、內部控制制度不同
手工核算時，內部控制是通過憑證傳遞流程(明確各工作點要完成的任務，在傳遞流程中選擇控制點)和相互驗證來實現的。另外，對賬、核對賬證是否相符、賬賬相符、賬實相符等內控方法。也用於保證數據的正確性和堵塞漏洞。
在電算化會計中，由於會計處理程序和會計工作組織體系的變化，除了原始數據的收集、審核和編碼仍由原會計人員手工操作外，其余均由計算機部門處理。顯然，原來的內部控制方式被計算機部分取代，由人工控制改為人機控制。後者的控制要求更嚴格，範圍更廣。因此，有必要加強會計電算化中的內部控制。
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