壹、 硫磺消毒法
這是傳統的消毒方法，已沿用多年，就是在庫內將工業硫磺與鋸 末混合點燃，然後密閉12—24小時後通風排氣的庫房消毒法，壹般標準用藥量為4—6g/m3，但貯戶用藥量壹般為20 —25g/m3，2000m3的庫房壹般用藥40—50kg左右，這種消毒方法在果蔬商業冷庫貯藏的前期，也就是80年前後至95年期間用該法最多。該消毒方法雖然簡單易行，但副作用極大，硫磺點燃後產生二氧化硫 ，二氧化硫遇水形成亞硫酸等物質，該酸性物質對果蔬貯架、風筒、蒸發器有很強腐蝕作用，在其表面生銹，降低該設施使用安全性，連續使用該法消毒的冷庫有些出現過倒架、漏氨等現象，給貯戶造成較大損失，用該法消毒弊大於利，目前只有極少數偏僻的冷庫仍沿用此法。
二、 甲醛高錳酸鉀法
目前各冷庫壹般按甲醛與高錳酸鉀2：1的重量比將甲醛溶液慢慢註入高錳酸鉀中，然後密閉48 小時再通風排氣的消毒方法，壹般標準用量為每立方用40%的甲醛溶液10ml與高錳酸鉀5g混合，按2000m3庫房計算，用20kg甲醛溶液及10kg高錳酸鉀，這種方法也起到較好的庫房消毒效果，但該法產生的氣體對人刺激很大，庫房熏蒸後長時間難以排除刺激性氣體，以至於能影響果蔬入庫進度，貯戶不得不采取提前十幾天熏庫、然後3—5天連續用風機排氣，連續排風又將庫外的壹些病菌重新帶入庫內，造成庫內消毒不徹底，按2000m3庫房計算消毒成本：甲醛20kg×2.6元/kg= 52.00（說明：去年甲醛2.60元/kg，今年價格要上漲到3.20元/kg）高錳酸鉀10kg×9.0元/kg=90元。光藥劑成本142元。在熏蒸後還用2.2kw的軸流風機通風3-5天，累計用電160-264度，以每度電0.8元計，用電耗資128-211元，累計成本270-406元。
三、FK庫房消毒片
FK冷庫庫房消毒片是由濟南營養源食品科技有限公司研制開發的庫房消毒產品，已在市場上推廣了近十年，深受廣大企業的歡迎，該藥消毒效果好，對鐵材無腐蝕，刺激性小，對庫房按4-5m3/片處理即能達到徹底消毒的效果，該產品使用方法如下：按4-5m3/片劑量計算用量，將其溶於水中（7-8片/kg）,然後由裏到外，均勻噴灑庫房空間和地面，噴灑完畢庫房密閉12小時，然後打開庫房門充分通風即可，以2000m3冷庫計算，只需400-500片即可（1瓶500片，銷售價25元）。處理兩次只需2瓶，成本只有50元。
四、FK庫房消毒煙劑
FK冷庫庫房消毒煙劑是濟南營養源食品科技有限公司在FK消毒片的基礎上研制開發出來的新產品，兩年來備受企業歡迎。它克服了FK庫房消毒片雖消毒徹底但操作不便且產生刺激性氣味的弊端，它含有兩種高效、安全、廣譜、快速的消毒成分，產煙速度快、煙量大、藥效高、易點燃、發煙過程無明火、無殘毒、無公害，能快速殺滅各種細菌、真菌、芽孢病毒等病原微生物。該煙劑點燃達到壹定溫度後便分解放出氯氣，氯氣具有消毒殺菌作用，且該藥劑比其他含氯消毒殺菌劑藥效更強。在蒜苔貯藏技術較先進的山東壽光，前幾年大都用甲醛高錳酸鉀法進行庫房消毒，自去年該藥在該地推廣後深受廣大貯戶歡迎，去年該地入貯蒜苔的400個庫房有270多個用該藥消毒，有些庫房在已購買了甲醛與高錳酸鉀後放棄使用而改用該煙劑消毒，當然去年由於“非典”原因，該藥原材料受限，公司消毒劑斷貨，致使壹些本打算用該藥的貯戶只好用甲醛高錳酸鉀。以2000m3庫為例，按3克/m3計，***用6Kg，消毒成本只有6kg×28元/kg=168元。消毒後不用再排風，不至於造成二次汙染，且消毒24小時後即可開庫入貯蒜苔，無刺激性氣味。