醫學哲學是哲學在醫學領域的分支，是對醫學中壹般規律和範疇進行哲學研究的壹門邊緣性學科。
醫學哲學的研究領域是醫學，但研究對象不是醫學及其分支學科所關註的具體現象和具體規律，而是普遍現象的壹般本質和壹般規律。因此，醫學哲學是醫學最高層次的理論學科，又是介於醫學與哲學之間的交叉學科，也是壹個充滿活力、爭議不斷、與時俱進的學科。
醫學哲學既古老又年輕，因為醫學哲學思想早在中國西周、西方的古希臘時期就已經萌芽了，而醫學哲學作為壹種學科，不過有幾十年的歷史。
醫學哲學的歷史就是醫學與哲學相互聯系、相互結合的歷史，從最初的醫學辯證法發展到日益膨脹的醫學人文社會學科群（如醫學社會學、醫學倫理學、醫學人類學、醫學美學）。
在醫學沒有理性化之前，醫學家總是自覺或不自覺地用某種哲學觀點來指導自己的醫療實踐，總結自己的醫療經驗和成果。因此，醫學發展的歷史進程，總是受當時哲學思想的影響，與當時哲學思想的發展狀況相適應。
醫學哲學思想淵源悠久。我國傳統醫學所運用的語言材料、表述形態，都與古代哲學思想密不可分。《周易》之卦爻理論、中庸辯證法；《黃帝內經》中的天人相應思想及形神理論；宋明理學援引的太極本體論，都勾勒出了傳統醫學的理論特色和方法論特點；中國傳統醫學以古代的陰陽五行說構建理論框架，認為“陰陽者，天之道也”，而“生之本，本於陰陽”。
人體健康是機體內部之間、機體與環境之間的對立統壹，即“陰平陽秘”，人體疾病是陰陽失衡的結果。中國古代的陰陽五行說本是壹種樸素的唯物主義和自發的辯證法，傳統醫學的陰陽五行說就是中國古代自然哲學思想與醫學相結合的結果，其蘊含的合理性對傳統醫學的疾病診治及西方醫學哲學影響深刻。