南京中醫藥大學翰林學院是壹所以中醫藥為特色的綜合性大學，其中包括多種專業，包括中醫學、中藥學、針灸推拿學、中西醫結合臨床醫學等。
壹、中醫學
中醫學是中醫藥大學翰林學院最重要的專業，它是中國傳統醫學的精髓，是中國古代醫學的主要內容，是中國文化的精華。中醫學的主要內容有：針灸推拿學、中藥學、中醫內科學、中醫外科學、中醫兒科學、中醫婦科學、中醫眼科學、中醫耳鼻咽喉科學、中醫口腔科學、中醫皮膚科學、中醫急診科學、中醫風濕病學、中醫骨傷科學等。
二、中藥學
中藥學是中醫藥大學翰林學院的重要專業，它是中國傳統醫學的主要內容，是中國文化的精華。中藥學的主要內容有：中藥材料學、中藥制藥學、中藥質量學、中藥藥理學、中藥藥物分析學、中藥毒理學、中藥護理學、中藥經脈學等。
三、針灸推拿學
針灸推拿學是中醫藥大學翰林學院的重點特色專業，它是中國傳統醫學的重要組成部分，是中國文化的精華。針灸推拿學的主要內容有：針灸學、推拿學、針灸推拿臨床應用、針灸推拿理論、針灸推拿經脈學、針灸推拿藥物學等。
四、中西醫結合臨床醫學
中西醫結合臨床醫學是中醫藥大學翰林學院的重要專業，它是中國傳統醫學的重要內容，是中國文化的精華。中西醫結合臨床醫學的主要內容有：中西醫結合臨床診斷學、中西醫結合臨床治療學、中西醫結合臨床護理學、中西醫結合臨床藥物學、中西醫結合臨床營養學、中西醫結合臨床免疫學等。
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