顯微鏡根據顯微原理可分為光學顯微鏡、電子顯微鏡和數字顯微鏡。
光學顯微鏡
通常由光學部分、照明部分和機械部分組成。毫無疑問，光學部分是最關鍵的，由目鏡和物鏡組成。早在1590年，荷蘭和意大利的眼鏡制造商就已經做出了類似顯微鏡的放大儀器。光學顯微鏡的種類很多，主要有明場顯微鏡(普通光學顯微鏡)、暗場顯微鏡、熒光顯微鏡、相差顯微鏡、激光掃描聚焦顯微鏡、偏光顯微鏡、微分幹涉差顯微鏡、倒置顯微鏡等。
電子顯微鏡
電子顯微鏡具有與光學顯微鏡相似的基本結構特征，但它具有比光學顯微鏡高得多的放大倍數和分辨能力。它使用電子流作為新的光源對物體成像。自1938年魯斯卡發明第壹臺透射電子顯微鏡以來，除了透射電子顯微鏡本身的不斷改進，還發展出了許多其他類型的電子顯微鏡。如掃描電鏡、分析電鏡、超高壓電鏡等。結合各種電鏡樣品制備技術，可以多方面研究樣品的結構或結構與功能的關系。顯微鏡被用來觀察微小物體的圖像。它常用於生物學、醫學和微小粒子的觀察。電子顯微鏡能把物體放大200萬倍。
臺式顯微鏡，主要指傳統顯微鏡，是純光學放大，放大倍數高，成像質量好，但壹般體積較大，不方便移動，多用於實驗室，不方便外出或現場檢測。
如何使用顯微鏡:
使用自然光源進行顯微鏡檢查時，最好使用朝北的光源，而不是陽光直射；使用人工光源時，宜使用熒光光源。
顯微鏡檢查時，身體應面向練習臺，采取正確的姿勢，自然睜眼，用左眼觀察標本，用右眼記錄和繪圖，用左手調節焦距，使物像清晰，移動標本視野。右手記錄和繪圖。
顯微鏡檢查時，載物臺不能傾斜，因為當載物臺傾斜時，液體或油容易流出，不僅損壞標本，還會汙染載物臺，影響檢查結果。
顯微鏡檢查時，標本的視野要向壹定方向移動，直至觀察到整個標本，以免遺漏或重復。
顯微鏡的重光是光線和物鏡的轉換和光線的調節。觀察寄生蟲標本時，光線調節很重要。由於觀察到的標本，如蟲卵、包囊等，都是自然光下的物體，有的大，有的小，有的顏色深淺，有的無色透明，低倍和高倍物鏡變化較多，所以在鏡檢時需要根據不同的標本和要求，隨時調整焦距和光線，使觀察到的物體清晰。壹般情況下，染色標本的光線要強，無色或未染色標本的光線要弱；低倍鏡頭觀察到的光要弱，高倍鏡頭觀察到的光要強。
註意事項:
(1)使用顯微鏡前，要熟悉顯微鏡各部分的名稱及其使用方法，尤其是識別三種物鏡的特點。
(2)寄生蟲學實踐中觀察到的標本大多是無色、淺色的，必須註意光線的調節。
(3)觀察新鮮標本時，應加蓋玻片，以免物鏡因蒸發而幹燥變形或汙染侵蝕。同時可以使標本表面平整，光線集中，有利於觀察。