海圖顯示，即將海圖數據（點、線、面）在可視化，供使用者查閱。電子海圖相比於紙質海圖，其顯示的信息多樣性和展示的靈活性的特點。
信息的多樣性可能包括：
展示的靈活性可能包括：
電子海圖顯示與紙質海圖投影規則壹樣，但與紙質海圖壹次性成形不同，電子海圖可根據不同航海需要隨時 選擇性地分層顯示 所需數據。電子海圖繪制其實是逐層繪制的，如空白海圖上先繪制淺灘，接著陸地，再山形線，最後燈塔等。電子海圖系統裏的全部數據，包括海圖信息、雷達信息和本船/AIS信息等，按照S-52標準進行分層與顯示優先級管理。在顯示過程中，當物標在空間範圍裏發生重疊時，要優先保證級別高的信息能夠清晰、完全被顯示，級別靠後的信息不能覆蓋其前級信息。
S-52標準中，ECDIS應將處理的數據至少分成10級（同壹級內也可存在多種物標要素、也可分為多層信息），分層信息如下：
海圖被解析完畢後，通過顯示庫獲取各物標的顯示優先級，先繪制優先級低的物標，再繪制優先級別高的物標；同壹級別內，按面、線、點的順序進行繪制。各物標的顯示優先級是事先預設並存儲在相關文件中，電子海圖系統使用人員 無需也無法 更改某類物標的顯示優先級。
由於航海數據的多樣性，全面顯示在有限的屏幕內可能會呈現出雜亂無章而無法辨別的情況。理論上，電子海圖屬於矢量數據，任何數據顯示與否都可由終端用戶自主選擇。但過分自由，有時會讓初級用戶無所適從，同時如果與航行安全相關的信息被誤操作隱藏起來，反而會造成嚴重後果。因此，電子海圖信息的顯示進行了三種分類層次的控制，以方便航海人員對海圖顯示信息的篩選查看。