B、制作豆腐乳要用到黴菌，黴菌的發酵需要在無氧的條件下進行，因此要密封，防止空氣的進入，不符合題意．
C、制作豆腐乳要用到黴菌，不是酵母菌，不符合題意．
D、制作豆腐乳之前要先把豆腐高溫煮沸滅菌，然後降溫冷卻後再用，符合題意．
故選：D