《中國的現代轉向》
《現代人的夢魘》（1966）
《海德堡語絲》（1986）
《中國社會與文化》（1993）
《中國民本思想史》（1993）
《中國現代化與知識分子》（1994）
《大學之理念》（1995）
《中國政治與文化》（1997）
《中國民主之困局與發展》（1997）
《從傳統到現代》（1997）
《金耀基自選集》（2002）
《劍橋語絲》（生活·讀書·新知三聯書店，2007）
《海德堡語絲》（生活·讀書·新知三聯書店，2008）
《大學之理念》（增訂版）（生活·讀書·新知三聯書店，2008）
《敦煌語絲》（牛津大學出版社，2008）
《敦煌語絲》（中華書局，2011）