1、流轉方式不同
電子支付是采用先進的技術通過數字流轉來完成信息傳輸的，其各種支付方式都是通過數字化的方式進行款項支付的；而傳統的支付方式則是通過現金的流轉、票據的轉讓及銀行的匯兌等物理實體來完成款項支付的。
2、支付媒介不同
電子支付使用的是最先進的通信手段，如Internet、Extranet，而傳統支付使用的則是傳統的通信媒介；電子支付對軟、硬件設施的要求很高，壹般要求有聯網的微機、相關的軟件及其他壹些配套設施，而傳統支付則沒有這麽高的要求。
3、用時和費用不同
傳統支付費用高，電子支付費用低。電子支付具有方便、快捷、高效、經濟的優勢。用戶只要擁有壹臺上網的PC機，便可足不出戶，在很短的時間內完成整個支付過程。
在電子商務中，支付過程是整個商貿活動中非常重要的壹個環節，同時也是電子商務中準確性、安全性要求最高的業務過程。電子支付的資金流是壹種業務過程,而非壹種技術。但是在進行電子支付活動的過程中,會涉及到很多技術問題。
傳統支付方式普遍使用的是發票、本票、匯票、信用卡、現金的方式，雖然以票據交換取代了現金流轉，給實際支付業務帶來了巨大的變化，但是，這種方式下的業務處理仍然存在著許多弊病。現今采用網絡交易的電子支付不僅能夠提高結算效率，更重要的是加快了資金周轉速度，降低了資金周轉的成本。