康熙七年(1668)，由於清廷對鄭成功求愛和戰爭不成功，福建水師最終下崗，沿海四省移駐沿海。施瑯被召入京任內政大臣，時不滿壹歲。他隨生母張進京。平時除了做家務，張十幾年來沒日沒夜地訓練兒子讀書，施瑯親自教導。
康熙十九年(1680)二月，施瑯的子侄石齊、施海在臺試圖為清軍泄憤，全家七十余人被鄭經殺害。施瑯得知此事後，發誓要報仇。因此，清廷消除了施瑯的嫌疑。
康熙二十年(1681)，鄭靜病死，臺灣省上層官員爭權奪利。為了立太子，殺了鄭克倉，爭取立少爺鄭克雙(12歲)，明鄭貪官多，人心渙散。官兵投奔清廷的事情不斷發生。施瑯長子施世澤及其家人被鄭靜殺害。在福建官員向清廷的推薦下，施瑯最終獲得了臺灣省的唯壹指揮權。
康熙二十二年(1683)，清廷發動關臺之戰。施世貞十七歲時，被任命為守備官，隨施瑯出征的有他的四哥施世傑、五哥施世貞、七哥施世華、施氏宗親等兩萬多名水軍將士。在激烈血腥的澎湖海戰中，石浴血奮戰，轉敗為勝。後禦使史世貞以戰功封左為都督。康熙三十年(1691)，時年24歲的石被授予山東濟南守備營參訓官。此後歷任中尉、連長、提督。長期在東南沿海，多次獲得康熙皇帝的嘉獎。
在濟南，史世貞以家法治軍，帶兵嚴重。康熙三十二年(1693)，施瑯進京朝聖，路過濟南。史世貞領著大軍沿路而行。施瑯檢閱後高興地說:“果然贏了我的治軍之法。”
康熙三十五年(1696)，康熙帝親自簽署噶爾丹。天津總指揮嶽勝龍打了個推薦，申請天下。康熙帝對嘗試騎射的號召相當滿意，下令天下護送軍糧到蘇葵。任務完成後，史世貞與馬思卡將軍追擊叛軍至巴彥烏蘭。3月21日，施瑯去世。石世貞得知後，懇求回福建安葬父親。康熙帝稱贊史毅勤奮，並命令他在父親葬禮後回到原來的崗位。康熙三十七年(1698)，史世貞遷居臨清，後任山東鄧州副都督。康熙四十年(1701)，調任浙江定海任連長。施時珍認為定海是浙江的北大門，海防重要。駐紮官兵壹定要居安思危，苦練軍事技能。他帶領他的部隊到沈家門練習水戰的方法。先是親自教進攻方用小船進退，後又用大船進外國分部，吹號螺螄，以旗色為令，槍炮威武，兵熟神勇。
康熙四十二年(1703)四月，康熙帝南巡，賜禦書“張辛敦禮”匾額作為鼓勵，並責成時任定海連長陪同前往普陀焚香。有了這個榮譽，史治軍更加嚴謹。當時浙江海盜猖獗，商旅幾乎絕跡。史世貞把士兵偽裝成商人和遊客，把軍艦改成商船，親自指揮，引誘海盜搶劫。海盜們不知道計劃是什麽，紛紛被捕，連寇守江倫也被抓去斬首。康熙四十六年(1707)，康熙又壹次南巡。當他聽說抓獲了海盜，得知天下迎來了自己的生母張下海，母親孝順時，就給了禦書壹塊“金堂玄茂”的匾額和壹根孔雀翎。
康熙四十八年(1709)八月，施時珍為廣東提督，從嚴治軍，繪制南海、東沙、西沙、中沙、南沙群島海圖，建立界牌，面積300萬平方公裏。為嘉慶年間繪制清朝統壹地圖提供了布局依據。這幅畫收藏在北京圖書館。康熙四十九年(1710)，常寧、英德等地有強盜出沒。史世貞立即出動官兵，四處抓捕。礦工們逃到長寧東學焦雷塘的鐵爐裏，勒索鐵爐販子，幾個人被鐵爐砸死。官兵們四處追捕，陸續抓獲，移交部門，依法懲處。考慮到山多路徑密，很難杜絕互相追逐。世界政府會同總督，委派文武官員到長寧、英德、從化等地探險，並設置守備部隊，設置防汛。並修建兵營扼住它的咽喉，切斷它的道路。
康熙五十壹年(1712)七月初，少府曲江縣的黃晨宇、黃仁生、賴，英德縣的何，被礦工洗劫壹空。石接到的報告，立即派出官兵從附近的營進行追捕。右營遊擊隊員許也奉命帶領官兵到縣交界的山野攔截。壹想到少府，邵禎全軍都要出動了，可這些礦工還敢搶農村，守著汛期的官兵也不盡力防備。而史毅本人就駐紮在離邵壹千多裏的徽州，不可能知道所有的原因。為了便於指揮，防止事態蔓延，7月15日，史世貞率秦鼎到英德、曲江、翁源等地，探查山野情況和官兵安置的地方。7月19日，我去了三水，得知上中在英德縣的家被燒被搶。石齊立刻派人命令遊擊隊員許分散官兵，四處攔截。兩名兇手被當場擊斃，50人被捕。
隨後，史毅駐守曲江、英德交界處，總督率部依山野詳察。經過調查，史世珍了解到劫匪有兩種。於是，他命令每個將軍從各種渠道購買線路，秘密走訪逮捕，並陸續逮捕了30名礦工，移交司法部門審判。由於施世珍的努力，廣東各地的治安狀況有所好轉。康熙五十壹年(1711)，石調任福建水師任提督，掌管全省水師軍務，控制金門、銅山(東山)、海壇(平潭)，兼掌臺省、澎湖，掌管中、左、右、前、前提督。金門、銅山、南澳等地壹年遊；北洋海壇、民安、三沙、篝火壹年遊；而臺灣省巡回賽每兩年舉行壹次，巡回賽分為將軍、總督、省長和地方長官年度巡回賽。史世貞接受了這個重任，在軍事上不敢懈怠。
康熙六十年(1720)四月，臺灣省朱義貴起義，攻占縣城，任命左右大臣、將軍等官員，號稱“中興之王”，全站震動。南澳連長施世貞、蘭廷珍奉命出兵臺灣省。六月，施世貞率水師乘潮登臺省，攻破安平鎮。朱壹貴被俘，押解回京，康熙頒發特功，賜東珠帽、黃帶、四龍團。8月13日，臺灣省航營地區突然“怨風雨，互相攻訐”。營中軍民傷亡慘重，史世貞整夜暴曬，病不起。兵民奔走，祈求神靈用自己的生命延長石世貞的生命。9月，他在部隊犧牲，享年55歲。贈太保太子，勇果，祭葬黃陵，占地數十畝(今泉州市江南鎮金兵村界)。石世貞死的那天，哭得像喪親壹樣。
施世貞死後，為了平息民憤，整頓臺灣省官僚，康熙六十年(1721)十二月中旬，清廷將梁文宣、同治王力、臺灣省知府吳冠昆、竹羅知府朱奎、已故知府王鎮斬首。這是康熙後期對貪官的嚴厲懲罰。在壹定時期內，對臺灣省官方行政產生了威懾作用。為了加強對臺灣省官員的監督，及時了解沿海地區的邊界情況，清廷還建立了每年從北京派遣滿漢禦史各壹人到臺灣省考察的制度。
雍正元年(1723)八月，宣布史已取臺省，這是“壹大功績”，“是給世襲壹等阿達的禮物”。