使命召喚4：現代戰爭講述了壹個近未來，俄羅斯邊境小國發生政變，該國總統被槍殺，壹個軍閥頭子阿爾薩德成為恐怖主義頭子，背後有石油大亨紮卡洛夫撐腰。遊戲以兩個人物為主角，約翰“肥皂”麥克塔維士為英國空勤團跟隨錢隊長在敵人後方突襲。傑克遜則為美國海軍陸戰隊兩棲強偵團，負責抓捕阿爾薩德。最後傑克森犧牲在了核爆炸中，肥皂通過阿爾薩德找出了幕後黑手，在幾乎隊友全體犧牲的代價下，肥皂終於幹掉了紮卡洛夫。使命召喚5：單人模式
玩家在戰役中會扮演多名士兵的角色。在太平洋戰爭中，主角是美國海軍陸戰隊壹師的列兵米勒（Private Miller）。米勒在馬金島狙擊日軍時被俘虜，但不久就被羅巴克下士（Corporal Roebuck）等陸戰隊隊員救下，並協同列兵波隆斯基（Private Polonsky）、蘇利文中士（Sergeant Sullivan）等戰友繼續展開進攻行動，壹直打到沖繩島的首裏城。
東線戰役的主角是蘇軍第62軍的列兵迪米特裏·彼得連科（Private Dimitri Petrenko）。在斯大林格勒，他躺在壹個水泉旁邊裝死，親眼目睹德軍處決他的戰友的情景。他與同樣躲過死劫的雷澤諾夫中士（Sergeant Reznov）發誓要對納粹士兵和戰爭幕後指揮納粹將軍海因裏希·阿姆澤爾（Heinrich Amsel）報仇。三年後，他們在東方戰線相會，和列兵切諾夫（Private Chernov）壹道加入第3突擊軍團，在馬科夫（Markov）的指揮下展開對柏林的進攻，最終成功攻陷德國國會大廈，插上了蘇聯國旗。
玩家可以控制的第三個角色是海軍士官洛克（Locke）。他是PBY Catalina反潛偵察機的武器操作手，只在“黑貓行動”壹個關卡中出現。他所在的小分隊進行了壹次對日本的空襲，之後營救了壹個被擊垮的美軍艦隊的幸存者。
6： 背景
故事發生在前作《使命召喚4：現代戰爭》的劇情之後5年。此時，俄羅斯已經被極端分子控制，紮卡耶夫也被宣傳成了新的俄羅斯英雄。與紮卡耶夫有密切關聯的恐怖主義者弗拉基米爾·馬卡洛夫掌控了俄羅斯激進恐怖組織，世界再次不安定起來。為了應對嚴峻的國際形勢，英國空降特勤隊、美國中央情報局、美國海豹突擊隊等部門聯合成立了“141特戰隊”（141 Task Force），前作的主角“肥皂”則成為141特戰隊的隊長。
美軍劇情
在美軍劇情中，玩家可以控制三個人。壹位是約瑟夫·艾倫，壹位是詹姆斯·拉米雷斯，另壹位是在空間站裏的宇航員。
遊戲開始時，玩家控制的是隸屬於美國第75遊騎兵團的約瑟夫·艾倫（Joseph Allen），在阿富汗執行行動。後由於其表現優秀，被希普德將軍招募加入了141特戰隊，並指定為美國中央情報局潛伏在馬卡洛夫極端組織的臥底。不久，艾倫在馬卡洛夫的組織下到紮卡耶夫國際機場實行恐怖襲擊，向平民掃射。但隨後艾倫的身份暴露，在從機場撤退時被馬卡洛夫殺死。馬卡洛夫以此為“訊息”（Message），將責任推到美國身上。果然俄羅斯方面在機場事件調查之後認為這起恐怖襲擊與美國有關。之後俄羅斯利用ACS模組（見141特戰隊劇情段落）癱瘓了美軍衛星網絡，使其無法正常識別，並且海陸空三管其下，發動對美國的戰爭。
此時，玩家開始控制第75遊騎兵團的二等兵詹姆斯·拉米雷斯（James Ramirez），跟隨福利中士的領導，在華盛頓附近抵抗俄羅斯精銳部隊。戰鬥中，美軍發現壹枚洲際彈道導彈正向美國東海岸靠近，美軍司令部決定作出在華盛頓在導彈襲擊而失守後的最壞打算，與此同時，拉米雷斯所在小隊遭到伏擊，陷入危機。視角轉向太空，玩家控制壹名在空間站執行任務的宇航員，在太空中“觀看”了壹枚洲際彈道導彈高大氣層爆炸的情景（見141特戰隊劇情段落），隨後空間站被洲際彈道導彈爆炸產生的沖擊波擊毀，宇航員也不幸陣亡。而導彈爆炸後產生的強電磁脈沖（EMP）讓美國東部地區所有電子儀器（包括俄軍的）全部癱瘓。拉米雷斯所在的部隊戲劇性地得救（此時由於EMP襲擊，激光瞄準器等電子產品無法使用）。雖然導彈並沒有直接襲擊華盛頓城區，但美軍司令部真的以為華盛頓已經失守，準備對華盛頓發動毀滅性空襲，拉米雷斯的部隊得知這壹消息後，趁俄軍載具癱瘓之際重奪美國白宮，發射了信號彈，使美國空軍終止了空襲任務。到此美軍劇情就結束了。
141特戰隊劇情
在141特戰隊劇情中，玩家可以控制加裏·“小強”·桑德森中士，或是約翰·“肥皂”·麥克塔維什上尉。
141特戰隊的劇情開始於哈薩克斯坦的天山，玩家控制的人物是加裏·“小強”·桑德森中士（以下簡稱小強）和“肥皂”隊長，前往位於天山山脈的壹座俄軍機場，回收遺失的人造衛星ACS模組（ACS是攻擊識別系統），以防止機密落入敵手。然而俄羅斯還是趕在141特戰隊之前，破解了該模組，並在機場事件後利用模組中的相關資料癱瘓了美國衛星，向美國發動戰爭。
141特戰隊判斷，戰爭的主謀是馬卡洛夫，於是開始調查馬卡洛夫的蹤跡。隨後，他們發現巴西存在壹個可能與馬卡洛夫有關的軍火商，於是前往裏約熱內盧，但沒有得到任何有價值的情報。在壹場人質解救行動任務之後，謝菲爾德將軍要“肥皂”等人去俄羅斯“古拉得”監獄解救壹名罪犯，稱馬卡洛夫十分討厭這名罪犯。在激戰之後，特戰隊驚訝地發現罪犯就是《使命召喚4：現代戰爭》的普萊斯上尉，而他已經被關在監獄數年之久。“肥皂”歸還了普萊斯的槍（前作中殺死紮卡耶夫的手槍）。
成功解救普萊斯後，謝菲爾德將軍要求141特戰隊繼續追查馬卡洛夫的下落，但普萊斯要求利用極端手段先解決美國和俄羅斯的戰爭，中斷了與謝菲爾德將軍的聯系，並率領141特戰隊劫持了壹艘俄羅斯的核潛艇，並向美國華盛頓高大氣層發射了壹枚洲際彈道導彈。導彈爆炸之後，俄羅斯軍隊由於EMP襲擊而癱瘓，美軍的局勢終於得到逆轉。
隨後，在將軍的建議下，141特戰隊分成兩隊執行任務。壹隊由“肥皂”和普萊斯組成進軍阿富汗，而二隊則由“幽靈”和“小強”聯手調查馬卡洛夫壹座別墅。“小強”壹行雖然沒能發現馬卡洛夫，但截獲了非常重要的情報，不過就在撤離之時，“幽靈”和“小強”被前來接應的謝菲爾德將軍殺害，情報則落入了將軍之手。此後鏡頭轉到“肥皂”的部隊，普萊斯和“肥皂”等人在阿富汗的某廢舊飛機回收中心遭到了謝菲爾德將軍襲擊，但幸運的是，此時馬卡洛夫的部隊也在和謝菲爾德將軍的部隊交火，他們利用這壹混亂的局勢，在尼古萊（Nikolai）的接應下成功撤退。
普萊斯和“肥皂”漸漸明白了謝菲爾德將軍就是戰爭的幕後黑手。正是他將艾倫作為臥底安插到敵後，並藉由放出艾倫身份的資料，造成艾倫的死，引發了美俄大戰。而與此同時，普萊斯和“肥皂”被謝菲爾德將軍列為了全球通緝犯，為了為“幽靈”和“小強”報仇，手刃幕後黑手，孤立無援的他們聯系了原來的敵人馬卡洛夫，雖然馬卡洛夫因為當年殺死紮卡耶夫的仇恨，並未直接班師相助，但仍將謝菲爾德將軍所在的壹個阿富汗秘密基地的坐標透露給了普萊斯和“肥皂”。抱著“有去無回”的決心，普萊斯和“肥皂”潛入了這個秘密基地。在壹系列激戰之後，謝菲爾德將軍被身受重傷的“肥皂”飛刀插入頭部致死。隨後尼古拉坐了“小鳥”直升機來接應普萊斯和“肥皂”，並表示要帶他們到個“好地方”，141特戰隊的劇情到此結束。
關於真相
謝菲爾德將軍是五年前（即《使命召喚4：現代戰爭》劇情中）負責美軍線行動的總指揮官，也是壹名極端的愛國主義者（類似前作的紮卡耶夫）。在那次原子彈事件，他親眼目睹的幾萬士兵瞬間死亡的情景，美國的形象也受到了很大影響。謝菲爾德將軍更對在極端組織奪取俄羅斯控制權後美國政府的弱勢態度，以及原子彈事件後美國海外軍隊的窘景感到十分不滿。他決定利用馬卡洛夫來引起戰爭（即美俄大戰），希望在俄羅斯打擊下改變美國現頹廢的現狀且重塑美國的世界霸主形象，然後再想方法鏟除馬卡洛夫。