2008年初第壹版醫脈通正式上線，剛開始網站的定位是面向醫（學）生的醫學資源類型的網站，主要的功能也是滿足醫生在醫學資源、文獻等方面的需求。
2010年，醫脈通為了滿足醫生用戶的更多需求，對老版進行了全面的改版，在內容上增加了醫學資訊、病例、診療知識庫、圈子、我的醫脈通等頻道，力求打造壹個為醫生提供最優質服務的學術服務交流平臺。
2011年3月22日，醫脈通文獻服務上線，文獻服務頻道是基於醫脈通現有的pubmed漢化檢索工具開發的新頻道，在此基礎上突出了開放式的文獻討論和在線文獻管理的功能。文獻服務通過大量用戶討論文獻，查找文獻，幫助用戶迅速找到本領域高水平文獻，提高工作效率。它吸收了F1000，JWATCH等國外文獻服務網站的優秀設計，融合了SNS社會化網絡的先進理念，讓查找目標文獻更容易，讓跟蹤本領域的最新進展更加方便，讓閱讀文獻更加有趣。
2011年3月29日，增加了劃詞翻譯功能，面對英文文獻，不再犯難，只要妳用鼠標選取英文單詞，即可彈出翻譯結果。
2011年7月22日，醫脈通新版上線，新版醫脈通在信息架構上做了較大的調整，在原來“以個人為中心，輔助於各功能頻道”的基礎上，增加並重點突出了學科屬性。
2011年9月24日，醫脈通增加了人人、QQ、新浪微博和百度的第三方登錄，不僅可以用這些賬號登錄，同時大家也可以把醫脈通中好的內容分享到人人、QQ、新浪中去。