1.按照《出入境證件拍照指引》提交申請人照片。
2.提交申請人的身份證原件。16周歲以下未辦理居民身份證的，可提交戶口簿，解放軍軍人、人民武裝警察可提交軍人身份證明(軍官證、士兵證或警官證)。
3、按規定留存或驗證指紋信息。
4.在非常住戶口所在地申請往來臺灣通行證的，還須按照國家移民管理局的有關規定，在非常住戶口所在地提交符合申請條件的證明材料，但本通知“受理機構”部分第(壹)至(七)項規定情形之壹的除外。
5.經備案登記的國家工作人員和現役軍人，除持《赴臺批件》申請赴臺者外，應當提交其所屬單位或者上級主管單位按照幹部管理權限出具的同意辦理出入境證件的函。
6.16周歲以下的申請人還應提交監護證明(出生醫學證明、監護公證證明、戶口簿等。)並提交監護人身份證原件；監護人委托他人陪同的，還須提交監護人委托書，並提交委托人居民身份證原件。
擴展數據
《中國公民往來臺灣省管理辦法》規定:
第二十四條？大陸居民往來臺灣通行證有效期10年；臺灣居民來往大陸通行證分為五年有效期和三個月有效期。？
第二十五條？大陸居民往來臺灣通行證應當逐張簽註。簽註壹次往返有效，多次往返有效。
第三十條？持偽造、變造或者其他無效旅行證件出境、入境，或者冒用他人旅行證件的，可以依照《中華人民共和國中國公民出境入境法實施細則》第二十三條的規定處罰，可以並處500元以上100元以下罰款。？
第三十壹條？偽造、變造、轉讓、倒賣旅行證件的，除依照《中華人民共和國中國公民出境入境管理法實施細則》第二十四條的規定處罰外，可處500元以上3000元以下罰款。？
第三十二條？編造信息、提供虛假證明或者以賄賂手段獲取旅行證件的，依照《中華人民共和國中國公民出境入境管理法實施細則》第二十五條的規定處罰，可以並處500元以上100元以下罰款。？
有前款所列情形的，在處罰執行完畢後6個月內不受理其出境或者入境申請。？
第三十三條？機關、團體、企業、事業單位編造信息、出具虛假證明為申請人取得旅行證件的，暫停行使發證權；情節嚴重的，取消其資格；對直接責任人員依照《中華人民共和國中國公民出境入境管理法實施細則》第二十五條的規定處罰，可以並處500元以上1000元以下罰款。
公安出入境網上服務平臺-註冊居民辦理大陸居民往來臺灣通行證及簽註服務指引