在本格拉叢林裏，傳說藏著三個分別用金、銀、玉制作的神聖骷髏，將它們合為壹體便可激發神奇的力量，從而統治世界。正因為如此，本格拉叢林吸引了來自世界各地的野心家，然而這裏卻藏著壹個令他們聞風喪膽的人物，他就是骷髏奇俠。骷髏奇俠的真實身份是沃克爾家族，四百年前沃克爾的祖先落難於曼加勒島，並受到土著捷嘉達族的救助。在此之後，捷嘉達族被海盜消滅，他們的神聖骷髏也流落本格拉叢林，從此世代受骷髏奇俠的守護。
紐約商人傑克是壹位野心很大的商人，他希望通過神聖骷髏的力量來達到統治世界的目的。傑克派出手下闖入本格拉叢林，搶走了銀色的骷髏。新壹代的骷髏奇俠凱特沃克爾也追蹤到紐約，他發現傑克的手下奎爾就是當年曾經刺傷了父親的兇手。凱特找到在報社工作的戴安娜幫忙查找玉骷髏的下落，進過查找他們發現玉骷髏在壹家博物館中，於是兩人火速趕過去。結果在博物館中他們與傑克壹夥相遇，由於寡不敵眾玉骷髏被傑克搶走，凱特和戴安娜也被傑克壹夥抓住了。
傑克審問凱特為什麽也對玉骷髏感興趣，凱特騙他說自己是個收藏家，並趁他不防備逃走。和傑克壹夥的紐約警察到處追捕凱特，在動物園的動物的幫助下凱特順利的擺脫了警察的追捕。傑克通過到手的銀和玉兩個骷髏頭查到黃金骷髏頭的所在地，他帶著奎爾和戴安娜壹同上路，凱特也追蹤他們壹起踏上尋找黃金骷髏頭的飛機。
傑克壹夥來到黃金骷髏頭的隱藏地海底城，這裏是兇惡的海盜愛瑪幫的老巢，黃金骷髏頭也被海盜們保存著。海盜們抓住傑克和他的手下，並且要殺掉他們。傑克告訴海盜頭子神聖骷髏的力量，希望他能夠和自己壹起統治世界。海盜頭子不為所動並告訴傑克還有第四個骷髏頭，只有聚齊四個骷髏頭才能夠統治世界。第四個骷髏頭就是凱特手上的骷髏頭戒指。凱特為了救戴安娜挺身而出，他的突然出現引起了混亂，傑克壹夥也趁機殺死了海盜頭子，搶走了黃金骷髏頭。三個骷髏頭匯合到壹起果然有神奇的力量，傑克企圖用這力量殺死凱特，作為骷髏頭的守護者的凱特當然不會讓傑克輕易得逞，他和傑克展開了殊死搏鬥，依靠手上骷髏頭戒指的的神奇力量消滅了傑克壹夥。同時凱特也贏得了戴安娜的芳心。