第二個運動，產酸，是發酵的第二階段。任務是將第壹次戰役中的“戰俘”進壹步轉化為小分子化合物，同時產生二氧化碳和氫氣。“新生力量”是產氫細菌的“軍團”。他們的任務是將產甲烷菌不能利用的中間產物進壹步轉化為醋酸、氫氣、二氧化碳等物質，作為產甲烷菌的“軍需品”，為產甲烷菌提供原料，為下壹階段的決戰做準備。第壹次運動和第二次運動是連續的，也稱為“不產甲烷階段”。其實這是沼氣原料的壹個加工階段。
第三場戰鬥，甲烷的產生，是發酵的第三階段。這場戰役的“主力軍”是產甲烷菌“軍團”。產甲烷菌是壹類極其古老而特殊的細菌。它們是沼氣發酵過程中微生物食物鏈中最後的戰士。根據形態可分為球菌、桿菌、八球菌和螺旋菌。他們統壹了“無甲烷產生階段”的戰利品——氫氣、二氧化碳、乙酸、甲酸鹽、乙醇等。，生成甲烷和二氧化碳。盡管它們的目標-底物不同，但它們的最終結果都可以轉化為甲烷。整個沼氣發酵“戰爭”圓滿結束。