日本古書《河漢三事》記載:“納豆自秦漢始制。”起源於中國的豆豉，在日本曾被稱為“豆豉”，平城井出土的木簡中也有“豆豉”二字。豆豉是在寺院的寺院中制作，存放在大桶中，再由禪僧從秦漢時期傳到日本寺院，所以納豆最早是在寺院中發展起來的，也叫“湯納豆”或“鹹納豆”。
後來根據當地環境開發了納豆，比如日本用醬油代替豆豉，或者用醬油代替豆豉。在日本，基於各地區的特色，大龍寺納豆、大德寺納豆、壹休納豆、戴夫寺納豆、烏鎮寺納豆等地方特產流傳至今。
納豆的吃法:
1，納豆蘋果丁:納豆的吃法有很多種。平時和蘋果壹起吃，味道特別好。吃之前需要準備壹盒納豆和壹個蘋果。將準備好的黃豆倒入碗中，加入調料、醬油、芥末，用筷子同向攪拌三分鐘，在納豆之間拉出大量白色細絲。這時候把蘋果削皮，切成方塊在nattos裏拌勻，就可以直接吃了。
2、納豆拌飯:納豆拌飯也是其常見吃法之壹。吃的時候準備壹碗米飯，壹盒納豆，壹個雞蛋，食用油，黑芝麻。將米飯倒入盤中，將雞蛋放入鍋中煎熟，撒上黑芝麻，取出後蓋上米飯。取出納豆，加入調味料拌勻，然後放在米飯旁邊，用微波爐加熱兩分鐘，就可以享受到納豆搭配米飯的獨特味道了。