雖然西藥和中藥都含有化學成分，但本質上是不同的。因為中醫是天然的，而西醫是合成的。我們常說“人造的不如上帝造的”，上帝造的是指自然。自然是在長期進化過程中形成的，其中成分的比例和數量符合自然規律，而經過改造的人工破壞了數量和比例，也會引起質量的變化。提取了西醫認為有用的天然成分的精華，而那些沒用的成分實際上可能對其精華有輔助或其他相互制約。而且中醫的很多內容，現代科學也沒有研究清楚。比如中藥的某些成分，被西醫認為是精華，但它們進入體內後的變化過程就不是那麽清楚了。有些功能不是由必需成分發揮的，而是由其代謝的中間產物或終產物發揮的。西藥用的是單味藥，連復方都是提純的成分，而中藥用的是未加工的原料，幾味或幾味的這些復雜成分之間的相互作用比較復雜，而西藥沒有這麽復雜的相互作用。中藥也是經過炮制的，但這種炮制只是改變了它的味道或性質，並沒有改變它的成分或數量。西醫是靠化學成分起作用，而中醫是靠四氣五味、盛衰、歸經起作用。
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