首先，北鬥系統可應用於交通領域，如車輛自主導航、車輛跟蹤監控、車輛智能信息系統、車聯網應用、鐵路運行監控、遠洋運輸、內河航運、航線導航、機場場景監控、精密進近等。例如，在新冠肺炎疫情期間，為了避免人員聚集，北京推出了由北鬥系統支持的無人駕駛汽車，用於在壹些地區分發外賣和其他物品。
其次，北鬥系統還可以用於農林漁業等基礎產業。在農業方面，主要包括農田信息采集、土壤養分及分布調查、作物施肥、作物病蟲害防治、特種作物種植面積監測、農業機械無人駕駛、農田起壟播種、無人機植保等。在江蘇，有壹種基於北鬥系統的無人小麥播種施肥機，用於小麥的耕、種、管、收全過程。在林業方面，主要包括森林面積測量、木材數量估測、森林巡邏、區域邊界的確定等。其中，森林防火使用北鬥獨有的短報文功能。在漁業方面，主要包括漁船航行、漁政監管、漁船出入境管理等。特別是在沒有移動通信信號的海域，漁民可以利用北鬥系統的短信功能，通過北鬥終端向家人報平安。
北鬥系統還可以應用於公安，主要包括公安車輛指揮調度、警察現場執法、應急信息傳輸、公安授時等。陜西在壹線警車上安裝了基於北鬥系統的終端專用設備，沿街巡邏可隨時隨地發現險情。北鬥系統在防災減災方面也有奇效，主要包括災情上報、災害預警、救災指揮、災害通信等。2020年7月6日下午，石門縣發生特大山體滑坡。幸運的是，北鬥系統成功預警災情，沒有造成人員傷亡。