應該進壹步培養和選擇通過雜交產生的突變材料，以便選擇符合育種目標的新品種。育種選擇的方法主要有系譜法和混合法。系譜法是從雜種分離的世代中不斷選擇個體，並編號記錄，直到選出表現壹致、符合要求的單株後代(系)，再根據系的混合收獲選育品種。這種方法要求雜交組合、單株、系統、系統群等。對所有世代的育種材料都要按其親緣關系進行編號和記錄，使所有世代的育種材料都能有譜系，所以稱之為譜系法。典型的雜交方法是從雜交分離世代F2開始，所有世代按組合取樣混合種植，直到某壹世代才進行選擇，然後選擇優良系統選育品種。在典型系譜法和混合法之間有各種可供選擇的方法，主要包括:改進系譜法、混合系譜法、改進混合法、導數系統法和單粒子透射法。不同性狀的遺傳力不同。在雜交早期世代，遺傳力高的性狀常被選擇，而遺傳力中等或較低的性狀則留給後代。選擇的可靠性在個體選擇中最低，在系統選擇中略高，在F3或F4衍生系統和系統群選擇中最高。選擇的關註度也是最高的。因此，隨著雜種壹代的進展，選擇的註意力也從單株擴大到系統、系統群和衍生系統的評價。測試條件的壹致性對提高選擇效果至關重要。因此，需要設立控制區，采用科學客觀的方法進行鑒定，包括直接鑒定、間接鑒定、自然鑒定或現場鑒定、誘導鑒定或非現場鑒定。雜種早代材料多，壹般采用感官鑒定。晚生代材料較少，再做壹個準確全面的鑒定。
我國作物育種程序壹般包括以下幾個環節:原料觀察、親本育苗、選種育苗和產量比較試驗。壹般雜交育種產生優良品種需要7-9年。現代育種采用加速世代的方法，結合多點試驗、稀播等措施，盡可能縮短育種周期。
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