企業信息化程度低。
電子商務需要的是壹個相對平衡的運行環境，而不是壹兩家企業信息化水平提高就能實現電子商務。它要求企業不僅要鏈接到互聯網上，還要有足夠的後端支持系統來響應對方的即時服務請求並快速完成。通過電子商務的應用技術，整合企業的前後臺業務，協調內外部資源，對從客戶、經銷商、合作夥伴、核心企業到供應商的各個環節進行管理、優化和增值，實現供應鏈聯盟業務的合作、信息共享和集中管理，體現合作共贏的經營目標，全面提高企業的核心競爭力和服務對象的滿意度。如果企業信息化水平達不到要求的標準，就會出現壹方有需求，另壹方無法響應的情況。拼裝式電子平臺雖然可以為信息化水平較低的企業提供交易接口，但無法提供有效的後臺支持，更多的是流於形式，無法實現真正的電子商務。
根據ccid 2001 8月份的調查，中國只有不到5%的大型企業通過互聯網開展業務活動，只有11%的企業實施了ERP，只有不到20%的企業在信息化方面取得了滿意的效果。由此看來，大部分企業的信息化水平明顯不達標，成為制約電子商務發展的主要因素。大部分企業的信息化僅僅局限於內部辦公自動化的某個層面，應用還不太理想，還處於探索階段。因為電子商務要求的內部管理體系比較高端，只有企業內部的管理組織規範統壹，才能實現電子商務。顯然，提高企業信息化整體水平迫在眉睫，真正實現電子商務還有很長的路要走。
支付問題的影響
目前，電子商務交易的支付方式仍然非常復雜，只有少數幾種直接在網上支付。企業通常使用信用證和傳統的支票轉賬支付，而個人則通過郵件轉賬、貨到付款(現金)、網上支付等方式進行網上支付。由於支付形式不同，電子商務的交易效率受到很大影響，這與銀行自身信息化程度低，相關法律法規不完善有很大關系。
信息系統在大型企業的應用現狀
我國商業銀行還處於通過互聯網提供網上支付的初級階段，覆蓋面小，遠遠不能滿足網上業務支付的要求。據CCID調查，網上直接支付僅占國內電子商務交易總額的17%左右。目前，國內大部分銀行僅提供壹些基本的支票、電話轉賬和信用證服務，其網上主動支付服務有限，且僅在部分大中城市提供此類服務，遠不能滿足電子商務所需的網上支付流程。雖然各大商業銀行都在做相應的努力和調整，但短期內很難突破這壹限制。顯然，這些都是急需改進的。壹方面要加快銀行的信息化建設，另壹方面要盡快完善網上交易的相關安全規範。只有真正實現電子支付，電子商務的優勢才會顯現出來。
物流對電子商務發展的制約
物流管理是保證企業持續生產經營的必要條件。企業的生產經營活動表現為物質資料的流入、轉化和流出過程。壹旦某個環節未能及時獲得所需材料，就會擾亂企業正常的經營活動秩序。其次，物流管理決定了企業的銷售情況和市場份額，企業能以什麽價格提供多少品種和數量的物質產品，決定了企業滿足消費者需求的能力，這是決定企業銷售量和市場份額的關鍵。在電子商務交易中，所要求的不僅僅局限於內部的物流管理和配送，對外部的協調也有更高的要求，從而形成整體價值鏈的優化。由於缺乏專業的管理和運營經驗，我國物流市場沒有形成閉環的網絡鏈條。郵政在壹定程度上起到了這個作用，但遠遠不能滿足電商要求的配送流程。還有小的發行公司，實力小，操作不規範。大部分是碎片化的，受地域限制大，很難提供完整的服務請求。雖然國外壹些大型快遞公司也急於涉足這壹領域，但目前並未獲批。顯然，電子商務物流配送的重點是倡導交易過程的時效性，這就要求物流公司提供全方位、多層次的物流運輸系統，來完成整個交易環節中的配送過程。
安全問題的障礙
安全問題對電子商務的發展有著至關重要的影響，是電子商務健康發展的保障。無論是行業立法還是安全技術都需要進壹步完善，以促進網上交易安全問題的解決。在沒有更好的技術解決方案時，需要盡快出臺相應的政策法規來規範網絡交易活動。CCID的調查顯示，超過85%的企業非常關註網上交易的安全性。無論是參與過電子商務交易的人，還是沒有參與過電子商務交易的人，對這個問題的看法都是壹致的。他們都認為網絡交易的安全性不容忽視。它涉及信息保密、支付、信用擔保、爭議裁決等壹系列商務活動。但立法明顯滯後於現實交易的需要，特別是隨著入世在即，利用電子商務交易的國際貿易活動將更加頻繁，更加迫切地面臨開放商務環境下電子商務的安全立法要求。
個人對網上交易安全性的重視程度不如企業，壹方面是因為交易金額小，另壹方面是因為采用的支付方式不同。在調查中，個人非常擔心網上交易的安全性，占27%，有些擔心，占61%，不擔心的只有12%。公眾對當前網絡交易安全性的信任度仍然較低，由此產生的心理影響不可避免。在調查中發現，有過網上交易經歷的人比沒有經歷過的人更不擔心。看來，除了安全技術和立法需要完善之外，網絡交易的安全性也不應該被誇大宣傳，這容易對試圖參與交易的個人形成心理障礙。
人才限制
高級管理信息人才的短缺制約了電子商務的發展。它要求管理信息人員運用現代管理思想，將信息技術與企業的運營組織有機融合，協調應用電子商務支持系統，這些系統應包括ERP(企業資源計劃)、SCM(供應鏈管理)、CRM(客戶關系管理)、EAP(企業應用門戶)等幾個子系統，從而全面優化企業價值鏈，提高企業整體管理水平。它涉及到企業采購、生產、營銷、服務的所有工作流程，加大這方面人才的培養已經成為發展電子商務的先決條件。CCID調查顯示，80%的企業迫切需要引進高級管理信息人才，以促進電子商務的規劃、管理和建設。只有真正解決人才約束這個前提，電子商務才能真正實現與傳統行業的融合升級。
縱觀市場形勢，雖然諸多不利因素制約著電子商務的發展，但隨著企業信息化水平的不斷提高和各種積極因素的推動，電子商務的整體運行環境將逐步改善，企業將更多地采用電子商務交易形式進行經營活動，因為這不僅僅是交易形式的變化，而是社會發展和企業運營的必然需求。