中醫產生於原始社會，春秋戰國中醫理論已經基本形成，出現了解剖和醫學分科，已經采用“四診”，治療法有砭石、針刺、湯藥、艾灸、導引、布氣、祝由等。
自古以來就有“醫道相通”的說法。這種影響最早可以追溯到黃老道家的典籍——《黃帝內經》，它是中國傳統醫學四大經典著作，也是我國醫學寶庫中成書最早的壹部醫學典籍。同時是研究人的生理學、病理學、診斷學、治療原則和藥物學的醫學巨著。在理論上建立了中醫學上的“陰陽五行學說”、“脈象學說”“藏象學說”、“經絡學說”、“病因學說”“病機學說”、“病癥”、“診法”、論治及“養生學”、“運氣學”等學說，後來的中醫學和養生學則在先秦道家思想的基礎上，開始用陰陽五行解釋人體生理，出現了“醫工”，金針，銅鑰匙等。東漢出現了著名醫學家張仲景，他已經對“八綱”（陰陽、表裏、虛實、寒熱）有所認識，總結了“八法”。華佗則以精通外科手術和麻醉名聞天下，還創立了健身體操“五禽戲”。唐代孫思邈總結前人的理論並總結經驗，收集5000多個藥方，並采用辨證治療，因醫德最高，被人尊為“藥王”。唐朝以後，中國醫學理論和著作大量外傳到高麗、日本、中亞、西亞等地。兩宋時期，宋政府設立翰林醫學院，醫學分科接近完備，並且統壹了中國針灸由於傳抄引起的穴位紊亂，出版《圖經》。金元以降，中醫開始沒落。
明清以後，出現了溫病派時方派，逐步取代了經方派中醫。在明朝後期成書的李時珍的《本草綱目》標誌著中藥藥理學沒落。同壹時期，蒙醫、藏醫受到中醫的影響。在朝鮮東醫學也得到了很大的發展，例如許浚撰寫了《東醫寶鑒》。
自清朝末年，中國受西方列強侵略，國運衰弱。同時現代醫學（西醫）大量湧入，嚴重沖擊了中醫發展。中國出現許多人士主張醫學現代化，中醫學受到巨大的挑戰。人們開始使
用西方醫學體系的思維模式加以檢視，中醫學陷入存與廢的爭論之中。同屬中國醫學體系的日本漢方醫學、韓國的韓醫學亦是如此。2003年“非典”以來，經方中醫開始有復蘇跡象。
在文化大革命期間，中醫作為“古為今用”的醫學實例得到中國***產黨政策上的支持而得以發展。現代，中醫在中國仍然是治療疾病的常用手段之壹。
在國際上，針灸引起醫學界極大興趣。針灸已被證實在減輕手術後疼痛、懷孕期反胃、化療所產生的反胃和嘔吐、牙痛方面是有效的且其副作用極低，然而，對慢性疼痛，背部疼痛以及頭痛，數據顯示出模棱兩可或者爭議性。WHO認為很多針灸和壹些草藥的有效性得到了科學雙盲研究的較強支持，但是對於其它的傳統療法還需要進行進壹步研究，而且不能忽視未經研究的傳統療法存在的安全性及危險性等問題。WHO在2002年5月26日發表“2002－2005年傳統醫藥研究全球策略”，邀請全球180余國將替代醫學納入該國的醫療政策。
上世紀90年代發起的現代中醫基礎理論的原始創新、革命。中醫新哲學觀中醫三個哲學觀：整體觀、辯證觀，及新挖掘出的中醫第三哲學觀：相似觀－分形論。
1996年，學界對中醫氣本質、經絡實質、陰陽、五行、藏象和中醫哲學觀等都有了新的創造性的認識和解說。如鄧宇等發現的：氣是‘信息－能量－物質’的統壹體；分形分維的經絡解剖結構；數理陰陽；中醫分形集：分形陰陽集－陰陽集的分形分維數，五行分形集－五行集的分維數；分形藏象五系統－暨心系統、肝系統、脾系統、肺系統、腎系統；中醫三個哲學觀－新提出的第三哲學觀：相似觀－分形論等。還包括近代針灸經絡的發展史，近代中醫氣的進展簡史，中西醫結合史，中醫中藥史等。