中國農業勞動力的受教育水平普遍較低。受過高等教育、正值壯年的農村“精英”大多去就業了，留下了從事農業生產、素質較低的婦女和老人。由於缺乏文化知識，接受新事物和學習新技術的能力受到阻礙，“賤糧傷農”現象頻發。由於缺乏科技知識，壹些高科技成果難以推廣應用，難以實現生產過程機械化和生產技術科學化。低素質低技能農業勞動力過剩，高素質高技能勞動力短缺，農業向高端升級遭遇勞動技能障礙。
二、農業產業化水平差，難以強化現代農業發展的基礎。
總體上看，我國正處於傳統農業向現代農業的過渡階段，工業化進程緩慢，仍未跳出小規模、低水平、傳統粗放的生產方式，農業機械化水平低，生產效率低。細碎土地的小規模經營和兼業經營方式導致專業化、標準化程度低，農產品產量低、質量差，不能滿足大型農產品加工業對規劃種植、養殖基地的需求。很多加工企業要從很多分散的小農戶手中收購農產品，大大增加了收購成本。
三、農產品質量不高，難以保證現代農業的發展。
中國正處於工業化和城市化加速階段，這是壹個高能耗和高汙染排放強度的時期，扭曲的市場機制驅動著工業的畸形增長。隨著工業和城市用水量的迅速增加，與農業用水的矛盾越來越難以調和。由於缺乏嚴格的保護和控制措施，水汙染導致水資源質量進壹步下降。在這些因素的綜合影響下，中國的水資源供應更加緊缺。工業汙染導致許多農產品原料質量低下，不能滿足加工業對農產品質量的要求。壹些農業生產者受利益驅動，濫用化肥農藥，導致農產品安全問題，加工產品出口和國內市場銷售受到影響，從而影響現代農業的發展進程。
四是促進現代農業發展的綜合服務體系不夠完善。
農業社會化服務體系是為農業生產提供產前、產中、產後綜合配套服務的專業組織。服務內容涉及銷售、信息、科技、材料、加工、勞務、財務、經營決策、政策和法律服務。在我國許多地區，各類行業協會和專業合作組織發展不平衡，總體規模較小，服務形式單壹。如何促進現代農業的發展，如布局規劃、項目可行性研究、決策咨詢以及相關的農業擔保、保險等服務還很欠缺。