1961年以前使用的酶的名稱都是習慣沿用的，成為習慣名。主要依據兩個原則： 如水解酶、轉移酶、氧化酶等。有的酶結合上述兩個原則來命名，如琥珀酸脫氫酶是催化琥珀酸脫氫反應的酶。
習慣命名法比較簡單，應用歷史較長，盡管缺乏系統性，但現在還在被人們使用。