無菌蛋是洗幹凈了表面上的汙物，再用殺菌光線照射，殺滅雞蛋表皮的細菌（紫外線基本不能穿透蛋殼，只對蛋殼表面有作用），因此如果蛋裏面沒有細菌的話，消滅了蛋殼上的細菌，就可以很大程度地保證安全了。
但這並不代表表皮消毒的蛋就壹定安全，因為如果雞本身就有病，感染了細菌，生出來的雞蛋也可能有問題。以及本身感染寄生蟲的話，蛋裏有蟲也未嘗不可能。
因此可以生吃的雞蛋除了要對雞蛋殼表面殺菌消毒之外，還必須在養殖雞的時候就保護雞的健康，讓雞吃幹凈的飼料和水，不讓雞出籠子去吃蟲子、吃草之類的，以便隔絕寄生蟲汙染。
無菌蛋也沒有想象中安全，如果飼料保存不當，養殖工人操作不規範，壹樣有可能讓雞遭受寄生蟲汙染。