傳統的貨運代理業務與現代的物流服務相比較，主要有以下壹些區別：
第壹，現代物流服務企業必須掌握先進的管理技術，溝通各有關單位全憑信息交換和信息處理的技術與設備；傳統貨運代理主要依賴貨運設備，如倉庫、車隊等，在貨運代理業務中，信息的來源主要依靠客戶自行提供。
第二，貨運代理服務通常是以客戶指示為出發點，相比較而言，這種服務是被動的；而物流服務的目標是不斷地滿足客戶的需要，幫助客戶制定經營策略，因而是主動的，具有導向作用。
第三，現代物流服務並不壹定從事具體的貨運工作。其主要任務是通過向有關客戶推銷先進的貨運壹體化管理技術，著重對整體運輸環節進行控制，從而對客戶提供運輸管理服務，因此，他們不壹定像貨運代理人那樣，實際從事具體的貨運工作，將客戶的貨物從某壹點運到指定的另壹點。
第四，貨運代理人僅參與和貨運有關的活動，但現代物流服務還可能向顧客提供全球性訂貨與供貨服務。因此，現代物流服務的範圍更廣，與供應鏈上的企業聯系更為緊密。
第五，現代物流服務企業更需要完善的物流網絡，如何建立健全自己的物流網絡比起只從事貨運代理的企業更加重要。沒有完善的網絡就無法做好供應鏈的管理與運輸服務工作。
由此可見，現代綜合物流對貨運代理行業形成的最大挑戰是，貨代企業能否打破傳統的經營思路，與物流的供應主體和消費主體打成壹片，將過去分散的海運、陸運、空運、倉儲業有機地結合在壹起，向貨主提供比貨運或貨代企業更全面、更系統加工、包裝、裝卸、倉儲、運輸、分撥、報關、報驗等壹體化服務，其信息跟蹤的全過程滲透到生產、加工和分消諸環節，囊括了物流、商流、資金流、信息流等各個部分。